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ゲノム編集 ゲノム編集関連製品 funakoshi news ゲノム中の PiggyBac トランスポゾンの コピー数を算出するキット 対立遺伝子のジェノタイピングキット EZ-Genotyping Kit PiggyBac Copy Number qPCR Kit 製品ページ番号:9015 System Biosciences 社 の PiggyBac Transposon Vector System(p.16~17 参照)によってゲノム中 に挿入した PiggyBac トランスポゾンのコピー数を, qPCR により算出するキットです。 特 長 ● UCR1 プライマーによってゲノム数を,PBcopy プライマーに 製品ページ番号:34775 PCR を用いて,多くの哺乳動物細胞中の標的対立遺伝 子の遺伝子型を,効率良く決定できるキットです。同一 チューブで PCR グレードのゲノム DNA を,迅速に抽 出できます。 特 長 ● 50 試料分のジェノタイピングを行うのに必要な試薬を含みます。 ● 操作は簡便で,長時間の酵素処理やゲノム DNA のカラム精製 は必要ありません。 よってゲノム中の PiggyBac トランスポゾンのコピー数を算出 し,それぞれの Ct 値からトランスポゾンのコピー数を算出します。 ● ΔΔ Ct=2 Number of Copies per Genome 100 100 100 100 100 23.82 19.88 19.05 18.77 18.15 28.43 24.74 24.69 24.97 24.49 ΔΔ Ct: copy# 2^-(PBcopy(ΔΔ Ct/2) UCR1) 24.47 12 29.00 15 49.76 25 73.29 37 80.92 40 性/汚染分析などに適用できます。 y=0.0352x+7.4258 R2=0.9388 35 30 Results Sample Preparation Cultured cells 45 40 M M 1 2 3 4 PCR Incubate at 95℃ 5 min ∼ 2 hours 5 6 7 8 9 10 Gel Electrophoresis ∼ 1 hour M M 25 20 15 KO 1,281 bp WT 1,067 bp 10 5 0 0 400 600 800 200 PB Transposon added (ng) (PBase held constant at 100 ng) WT: Samples 1 and 3 KO Mono- allele: Samples #4, #5, #6, #7, #8, #9, #10 KO Bi-allele: Sample #2 1,000 Genotyping results for validation of allele status in gene targeting assay using homologous recombination(HR)targeting vector. 品 名 メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥) PiggyBac copy number qPCR Kit(20 reactions) SBI PBC100A-1 品 名 1 kit / 45,000 本誌に掲載されている製品はすべて研究用です 製品ページ番号について フナコシホームページで各製品の詳細をご覧いただけます。 検索 ハイスループットのスクリーニング,混合/クローン細胞中の 遺伝子型の同定,DNA フィンガープリントおよび細胞同一 Transposon Transposase PBcopy UCR1 avg (ng) (ng) avg Ct Ct 100 300 500 700 1,000 同じチューブ内でゲノム DNA の抽出を行うため,PCR におけ る二次汚染を低減できます。 ● ※qPCR 試薬が別途必要です。 22 ● copy 数=ΔΔ Ct÷2, -(avg PBcopy Ct-avg UCR1 Ct) フナコシニュース 2016 年 4 月 15 日号(No.609) 包装 / 価格(¥) 1 kit / 56,000 研究成果の製品化・販売をサポートします! フナコシは,ライフサイエンスの更なる発展を目指し,皆様の研究 http://www.funakoshi.co.jp/contents/ 製品ページ番号を入力 メーカー 商品コード EZ-Genotyping Kit(50 reactions) SBI GE200A-1 プルダウンで 「製品ページ検索」を選択 成果の製品化や販売のお手伝いをさせて頂きます。 詳細については,是非当社までお気軽にご相談・ お問い合わせ下さい。 Tel. 03-5684-1653 Fax 03-5684-1654 e-mail:[email protected] お問い合わせ先: 〈試薬〉TEL:03-5684-1620 / FAX:03-5684-1775 / e-mail:[email protected]