PubMed検索法 入門編

PubMed の使い方（入門編）
PubMed とは？
ア メ リ カ 国 立 医 学 図 書 館 （ NLM ） 内 の NCBI( 国 立 生 物 科 学 情 報 セ ン タ ー :National Center for
Biotechnology Information）が作成しているデータベースです。
統合検索システム Entrez の一部としてインターネットで無料公開されています。世界の主要医学系雑
誌に掲載された文献情報（雑誌名,巻号,ページ,タイトル,著者名,抄録）を検索することができます。
PubMed へのアクセス
学内・学外問わず、どこからでも利用できます。
筑波大学内または専用ＵＲＬから利用すると、
が、
表示され、OPAC（蔵書検索）や電子ジャーナルへのアクセス、
文献複写申込などが、容易になります。
●筑波大学専用 URL
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?otool=ijputslib
●筑波大学附属図書館 HP「資料案内」→「データベースリスト」から
PubMed へのリンクをクリックしてご利用ください。
PubMed の画面の見方
①検索ボックス
②使い方
1
・マニュアル
・FAQ
・チュートリアル
etc…
③ツール
・特定論文の検索
2
3
4
・書誌一括検索
・特定トピック検索
④情報資源
・MeSH
・Jornal
・臨床試験
1/7
etc…
etc…
PubMed の基本の検索
■STEP1：キーワード検索
1
3
① 検索ボックスにキーワードを入力
② 自動マッピング機能が働き、MeSH 用語
（索引語）や雑誌名などが表示されま
2
す。
③ [Search]ボタンをクリック
■STEP2：検索結果の絞り込み：Filter
① 検索画面の左側にある Filter エリアで、
絞り込み検索選択中の条件には
1
2
がつきます
② デ フ ォ ル ト 以 外 の 項 目 は 、 [Show
additional filters]で表示
・文献のタイプ
・フルテキストの有無
・出版時期
・ヒトまたは動物
・言語
・性別
・対象年齢
PubMed からのリ
ンクで絞り込ま
れます。筑波大
学で契約してい
る EJ 等は反映さ
れません。
・テーマ
③ 絞り込んだ条件は、検索結果上部に表
示されます。
※絞り込んだ条件は、[Clear all]をクリック
3
するまで有効
■STEP3：様々な検索ルール
例題 1
Point
小児喘息（child asthma）の薬物治療（drug therapy）に関する文献を探す
スペースで AND 検索
大文字・小文字どちらでも検索できます。１種類だけでなく関連する用語で何度か検索してみましょう。
※ひとつのフレーズとして検索したい場合は、
検索例 ： “child asthma”
“drug therapy”
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例題２ The American Journal of Medicine に掲載された Lehman J M 氏の論文を探す
Point
正式雑誌名 or 略誌名で検索
正式名 または MEDLINE の略誌名、ISSN を入力します。大文字・小文字の区別はありません。
ISSN は「‐（ハイフン）」を省略せずに入力します。
※ ISSN： International Standard Serial Number 国際標準逐次刊行物番号
個々の刊行物に与えられる固有の識別番号。 ISSN 0028-0836（Nature の ISSN）
Point
Last Name はフルで、First Name と Middle Name はイニシャルで検索
2002 年以降出版の文献には、フルネームで検索できる論文もあります。
※特殊な著者名の入力
St.Clair M → St Clair M (ピリオドは省略)
Smith AB 3d , Smith AB III →
Smith AB 3rd
Vaart JM van der
→ van der Vaart JM
※ O’brien J＠
→
O’brien J のみ検索。O’brien JM, O’brien JD 等は検索しない
検索例 ： The American Journal of Medicine Lehman J M
例題３ 腎不全（Kidney Failure）に関する論文のうち慢性（chronic）を除く。
Point
論理演算子を使う
AND（論理和）、OR（論理積）、NOT（論理差）が使えます。必ず大文字で入力します。ただし、AND は省略す
ることができます。
[OR] 慢性腎不全か尿毒症
[AND] C 型肝炎の薬物治療
A:慢性腎不全
A : C 型肝炎
B: 尿毒症
B: 薬物治療
A AND
検索例 ： “Kidney
B
Failure”
A OR B
NOT
[NOT]高齢者以外での褥瘡
A:褥瘡
B:高齢者
A NOT B
chronic
例題４ 論文タイトルに「breast cancer」が入っている文献を探す
Point
検索フィールドを指定する
雑誌名、タイトル、著者名など、検索するフィールドを明示的に指定したい場合は、そのフィールドをあらわす
タグを単語の後ろに[ ]で付け加えます。
検索例 ： breast cancer[TI]
PubMed のレコードには、データのフィールドを表すタグがそれぞ
れ付与されています。このタグを使い、フィールドを指定して検索
することができます。
また、各文献には MeSH という統制された主題のキーワードが付
加されており、これが特徴となっています。
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TI : タイトル
AB : 抄録
DP : 出版年
AU : 著者名
TA: 掲載誌名
MH : MeSH 用語
etc.
その他の入力のルール
Point
前方一致検索(Truncation)
単数形と複数形を一緒に検索するなど、語尾変化のある単語をまとめて検索したいときなどには、キーワ
ードの最後にアスタリスク(＊)を付けて検索します。
PubMed では、前方一致検索のみが可能なので、アスタリスクは常に最後に付けます。1 文字に「＊」を付
けて検索することはできません。
前方一致検索をした場合には、自動マッピング機能は解除されます。
Point
ストップワード
”a” “the” “of” “can” “that”等のような頻出する単語は検索では無視されます。このような単語をストップ
ワードといいます。ストップワードを含む複数の単語をフレーズとして入力したい場合は、” ”（ダブルクォーテ
ーション）で括ります。以下の URL で PubMed のストップワードを一覧できます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/table/pubmedhelp.T43
Point
特殊文字の入力方法
＊ ギリシャ文字
⇒英綴りで入力（（例）α ⇒ alpha）
＊ ハイフン
⇒ スペースに置き換え
＊ アポストロフィ、”! ? ％“ などの記号 ⇒ 省略
＊ ウムラウト、アクサン
＊ 分子式 ((例) H2O ,
⇒ 省略
39 degrees C.) ２は通常の２とし、39 度Ｃは 39 degree C
■STEP4：詳細検索(Advanced search)
① 検索ボックス下の[advanced]をクリック
1
② Filter が設定されていたら解除
③ [Journal]を選択し、American Journal of Medicine
2
と入力
④ [Data-Publication] を 選 択 し 、 日 付 を 2006 to
present と入力
3
⑤ History か ら 最 初 の キ ー ワ ー ド 検 索 (Search
4
allergic)の Add をクリック
⑥ 検索式が入ったのを確認
し、
クリック
6
→指定した条件の検索結果が表示
5
※設定した条件は検索結果画面に表示される
「Clear all」をクリックするまで有効になります。
4/7
■STEP4：検索結果一覧の表示形式を変更
① デフォルトの表示は、「Summary」「20
1
2
件/1 ページ」「日付(最新)順」
② [Display Setting]をクリック
3
③ フォーマット、1 ページあたりの件数、
並べ替え順を選択し、[Apply]
④ 検索結果を出力したい場合は、保存/
メールしたい文献にチェックをつけ、
4
[Send to]をクリックし、保存形式を選
択
Point
検索結果一覧の見方
掲載誌名 出版年 月；巻（号）：ページ
本文が英語以外の論文は、PubMed 上では翻訳
されて［ ］でくくられています。
[Epub ahead of print]とは、オンラインのみで刊行
さ
れた論文です。冊子に先行してオンラインに掲載
される場合（後に冊子にも掲載）と、オンラインの
みで刊行されるものがあります。
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■STEP5：検索結果から論文を入手する
① 書誌情報
掲載誌名, 年, 巻(号), ペー
ジ
論文名
著者
② 抄録
③ PMID
④ 出版元へのリンク
出版社の EJ へアクセスします
が、筑波大学で契約しているか
どうかは反映されていません。
⑤ 関連文献へのリンク
⑥ Tulips Linker
全 文 を
(1) 電子
Point
入手できるかどうかは、[Tulips Linker]で一発解決。
ジャーナルが読めるかどうか → (2)筑波大学の図書館で所蔵しているか → (3)学
外 の図書館で所蔵しているか、の順に調べると効率的です。
① フルテキストへのリンク
② 附属図書館 OPAC を検索
③ 他大学の所蔵を検索
④ 国会図書館の所蔵を検索
⑤ 図書館の電子ジャーナルリストを検索
⑥ 文献複写申込（事前申請要・有料）
※本学に所蔵がないものについて、他の機関から複写物を取り寄せることができます。（雑誌のみ）
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参考文献
・PubMed Quick Start Guide
（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.PubMed_Quick_Start）
・東京大学医学図書館
PubMed の使い方
http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf
・東京慈恵会医科大学 PubMed の使い方 http://www.jikei.ac.jp/academic/micer/pubmed1.pdf
・図解 PubMed の使い方 : インターネットで医学文献を探す(第 5 版)
第 5 版, 2012 （⇒本学所蔵：医学 490.7-A12）
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岩下愛, 山下ユミ共著