未知のSNPの探索を お手伝いします!!

SNP
SNP 検出ソフト エスエヌピースポット
R
Spot
Windows 版 / Mac OS X 版
ver. 1
DNA配列 から
未知のSNPの探索を
SNP を 検出 !!
お手伝いします!!
SNPSpotは、DNAの配列を読み取る装置から出力される波
形データを元に、
遺伝子の個体ごとの違いを自動認識するた
めのソフトウェアです。
簡単な操作でDNA配列を整列(アライメント)し、
SNP候補を
自動で検出します。
プライマーの設計も可能です。
アライメントの編集
キー配列と異なる配列が上位に移動することで、
素早い編集が可能。
SNP の 検出
棒グラフで検出したSNP塩基の
比率を視覚化。
プライマー設計
● 重要
・本製品は研究用です。本製品を利用して得られたいかなる結果に対しても当社は責任を負いません。
・本製品はフランス国立ジェノタイピングセンター高橋正純、松田文彦両氏と株式会社ダイナコムが共同で開発しています。
・本製品に関する著作権はすべて株式会社ダイナコムに帰属します。許可なく複製または配布を行うことを禁止します。
・
「エスエヌピースポット」
、｢SNPSpot」
、
「ダイナコム」
、
「DYNACOM」は日本国における株式会社ダイナコムの登録商標です。
Copyright © 2006-2007 All rights reserved DYNACOM Co., Ltd.
検出したSNP用にプライマーの
候補を設計することが可能。
SNP 検出ソフト
エスエヌピースポット
SNP
ver. 1
R
SNP Spot データ解析フローチャート
DNA配列データ・波形データ
SCF形式
ABI形式
Genbank形式 FASTA形式
テキスト形式
DNA配列の個人ごとの違いの一つであるSNPは、オーダメイド医療や、健
康管理のために注目されています。
SNPSpotは、
このDNA配列を読み取る
装置から出力される波形データを元に、遺伝子の個体ごとの違いを自動
認識するためのソフトウェアです。
主な特長
●
参照配列に従い複数の配列データをア
ライメント、
各機能による編集の簡略化。
アライメント配 列 の ヌクレオチド よ り
SNPを検出、
波形データからのSNP検出。
●
プライマー設計
●
Excel形式
** メモリ、および、ハードディスクは、扱うデータ量によっては、さらに多くの空きが必要
になります。
SNPSpot
Ver. 1
Windows 2000/XP/Vista
メモリ
1GB以上**
ハードディスク
1GB以上**
その他
アライメントが完了していれば、自動でSNP候補を検出できます。混合サ
ンプル、倍数体DNAのDirect PCR産物の配列にも対応。各SNPのアレル
頻度を棒グラフで確認できます。
* 製品 CD-ROM は、Windows/Macintosh の Hybrid 仕様となっております。ライセンス
キーは両 OS で共通で、ご購入いただいたライセンス数分、同時に複数のマシンでご使用い
ただくことができます。
目
対応OS*
SNP候補の検出
テキスト形式
必要システム
項
アライメント結果の確認・編集
アライメントできていない箇所を素早く検索することができます。配列テ
キストと波形情報を連動して確認することができます。
SNP検出部位よりプライマーを抽出。
解析結果データ
配列のアライメント
インポートした配列をキー配列に対して簡単な操作でアライメントを行う
ことが可能です。配列数が多い場合などでもアライメントを高速に実行す
るための方法も提供。
SNP検出
検出結果のエクスポート
各種データのインポート機能
SCF、AB1などのシーケンサの出力ファイルをサポート。現場で独自にチ
ューニングしたベースコーラーを搭載。マルチFASTA形式、フラットファ
イルなどのテキストファイルからもインポート可能。
アライメント
●
G C A C T C ..
G C A G T C ..
G C A S T C ..
Windows 版 / Mac OS X 版
データのインポート
SNPSpot による解析
G C A C T C ..
G C A G T C ..
G C A S T C ..
Spot
Mac OS X 10.4.9以降
CD-ROMドライブ （本ソフトウェアインストールのため）
USBポート***
（詳細は、
右記を参照ください）
*** 本製品ではプロテクトキーによるユーザ管理を行います。そのため、ソフトウェア実行時
に、プロテクトキーを接続する USB ポート 1 個が必要になります。
このソフトウェアは、フランスの国立研究機関（フランス国立ジェノタイピングセンター）
の研究者である松田文彦部長、高橋正純上級研究員と株式会社ダイナコムとの共同で開発
しました。
仕様は予告無く変更される場合があります。
Windows, Excelは、米国マイクロソフト社の商標、または登録商標です。
MacとMac OSは、米国および他の国々で登録されたApple Inc.の商標です。
その他、掲載されている会社名、製品名は、各社の商標及び登録商標です。
● 詳細につきましては、下記までお問い合わせください。
本 社
千葉県茂原市茂原643 TEL 0475-25-8282 FAX 0475-25-8301
株式会社ダイナコム
http : //www.dynacom.jp/
e-mail : [email protected]
● 製品紹介ページ http://snpspot.com/
横浜開発センター
神奈川県横浜市西区楠町27-9 横浜ウエストビル4F
TEL 045-321-7800 FAX 045-411-5860
2007/10/22