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HiScan® システムおよびiScanシステム
Specification Sheet: Array Instruments HiScan® システムおよびiScanシステム イルミナBeadChipの高速・高感度・正確な画像処理をサポートし、業界最高水準の遺伝子解析 を実現する最新アレイスキャナー 製品の特長 • 高品質データ 実績あるInfinium®、GoldenGate® および遺伝子発現アッセ イにより、高いコールレートと業界最高レベルのカバー率を 実現 • 高サンプルスループット 高速光学スキャナー採用によりスキャン時間を大幅に短縮： 自動化オプションの追加によりアウトプットを最大化 • 高い柔軟性 多様なフォーマット、アプリケーションおよび自動化オプ ションに対応：HiScan システムはアップグレードにより次 世代シーケンス機能を搭載可能 柔軟で拡張性の高いシステム イルミナのアレイ製品は高密度化し、アプリケーション数も増 えて複雑化してきているため、これに対応したスキャナーが必 要となります。 HiScan システムおよび iScan システムは最新 のアレイスキャナーであり、BeadArrayTM テクノロジーを基盤 としたイルミナの遺伝子解析製品ラインを対象に高速、高感度 そして正確な画像処理を可能にします（表1）。 これらの高解像度スキャナーはイルミナの研究者とエンジニア によって開発され、幅広いアプリケーションにおいて業界最高 レベルのデータ品質を提供し、その高い柔軟性から多様な必要 スループットに対応します。 HiScan システムおよび iScan システムは、ジェノタイピン グ、CNV解析、DNAメチル化解析、遺伝子発現プロファイリ ングといった幅広いラインナップのイルミナ遺伝子解析製品 に対応します。リキッドハンドリングロボットとAutoLoader 2.x の併用による自動化アッセイはハンズオンタイムを短縮 し、スキャナーの24 時間稼働を可能にします。スキャナーお よび各構成コンポーネントはモジュール式となっているため、 システムのカスタマイズが容易であり、あらゆるレベルのス ループットに対応できます。さらに、HiScanシステムはオプ ションモジュールの追加により、アレイ解析に次世代シーケン スのパワーを統合した強力なプラットフォームを構築すること ができ、豊富な知見を得るチャンスもたらします。 革新的な画像処理システム HiScan システムおよび iScan システムは共に、高性能なレー ザー、光学機器、検出システムを導入しており、サブミクロン単位 の高解像度と比類ない高スループットを実現します。その結果、 データ品質や再現性を犠牲にすることなく、スキャン時間の大幅 な短縮に成功しました。最新のHumanOmni BeadChipは、 この 高性能なHiScanシステムの利点を最大限に活かすよう設計され ており、業界最高水準のスループットと、最多数の高品質なマー カーコンテンツを誇ります。 高い S/N 比、優れた感度、低い検出限界そして広いダイナミック レンジを特長とするHiScanシステムおよびiScanは、あらゆるバ イオマーカー探索あるいはバリデーション研究において、 これま でにない品質のデータを産出します。Infiniumアッセイにおいて は>99%という高コールレートを実現しており、 これにより強力な 全ゲノム関連解析あるいは高解像度CNV解析が可能となり、1コ ピーの変化でも検出することができます。HiScanシステムおよび iScanはさらに、アグリ・ゲノム研究において高速かつ正確なスク リーニングを可能にし、 また複雑な疾病研究のバリデーションにも 威力を発揮します。さらに、DNAメチル化解析および遺伝子発現 プロファイリングにおいてもシステムの高感度測定および広ダイ ナミックレンジが効力を発揮します。 表1：HiScanシステムおよびiScanシステムの概要 システム サンプルごとの平均スキャン時間（HumanOmni2.5-8 BeadChip） HiScan iScan 6.5 分 11.4 分 1 週間に処理可能な平均サンプル数（手作業）（HumanOmni2.5-8 BeadChip） 256 256 1 週間に処理可能な平均サンプル数（自動化）（HumanOmni2.5-8 BeadChip） 1,088 608 ○ × 次世代シーケンサーへのアップグレード HiScanシステムおよびiScanシステムはイルミナBeadChip用の高性能スキャナーであり、アレイを用いた遺伝子解析実験において業界最高水準のデー タ品質を提供します。HiScanシステムは、SQモジュールの追加により、アレイ解析およびシーケンス解析を同一プラットフォーム上で行えます。 Specification Sheet: Array Instruments 表2：HiScanシステムあるいはiScanシステムで1週間に処理可能なイルミナBeadChip数の例 自動化システム 2 サンプルごとの マニュアルロード 1 およそのスキャン時間（分） （1 週間あたりのサンプル数） （1 週間あたりのサンプル数） BeadChip HiScan iScan HiScan iScan HiScan Infinum HumanOmni5 15 26 128 128 480 iScan 272 Infinium HumanOmni2.5-8 6.5 11.4 256 256 1,088 608 Infinium HumanOmniExpress 4.1 5.0 384 384 1,728 1,440 InfiniumHumanOmniExpress+ 6.1 7.5 256 256 1,152 960 Infinium Methylation450K 5.0 5.0 384 384 1,440 1,440 Infinium HumanCytoSNP-12 1.8 2.9 384 384 1,728 1,728 iSelect® HD* 1.0 1.0 768 768 3,456 3,456 Universal-32 BeadChip for GoldenGate Genotyping 0.3 0.3 1,440 1,440 1,440 1,440 * スキャン時間はコンテンツによって変わります。 1 低スループット：オペレーター1名、HiScanまたはiScanシステム1台、16 BeadChip／バッチ、2バッチ／オペレーター。 2 高スループット：オペレーター1名、HiScanまたはiScanシステム1台、Tecan 2台、Autoloader 2.x 1台、24 BeadChip／バッチ、2バッチ／オペレーター／Tecan。 高スループットスキャン リキッドハンドリングロボット BeadArray 製品は高密度化が進んでおり、その結果全ゲノム HiScanシステムおよびiScanシステムには、カスタマイズされ たTecanリキッドハンドリングロボット（イルミナより販売・ サポート提供）を組み込むことができ、アッセイプロトコール の自動化が可能です。InfinuimアッセイあるいはGoldenGate アッセイのPCR前後の操作は（オプションのDNA定量以降） 全てロボットによる作業が可能であるため、実験に要する労力 を軽減し、なおかつ実験操作の一貫性を保つことができます。 ジェノタイピングにおいてはゲノムカバー率が増加、細胞遺伝 学および CNV 検出においては分解能が向上、また遺伝子発現 解析、 DNA メチル化解析、フォーカスジェノタイピングにお いてはサンプルスループットが向上しています。 HiScanシス テムおよびiScanシステムは高機能なレーザーおよび光学系を 有しているため、最も密度の高いマルチサンプルフォーマット のアレイをもスキャン可能であり、品質の高いデータを迅速に 産出します（表2）。 これまで何時間もかかっていたBeadChipのスキャンが分単位 にまで短縮されるため、1つの研究プロジェクトに関わる全サ ンプルをこれまでにないスピードで処理できるようになりまし た。解析時間の飛躍的な短縮は、すなわち研究結果を得るまで にかかる時間の短縮、そして研究費の削減につながります。 完全自動化に対応 手作業で行う実験よりも高いスループットを必要とする研究室に おいては、システムを自動化するためのオプション装置とソフト ウェアをご利用いただけます。自動化によってサンプル処理のス ループットが向上し、スキャナーを 1 日 24 時間稼働させるこ とができます。LIMS（Laboratory Information Management System：品質情報管理システム）の管理下で完全に自動化され たシステムは、最も強力で高スループットな構成です。 図1：デュアルスキャナー-Autoloader 2.x構成の例 2350 mm AutoLoader 2.x HiScan シ ス テ ム お よ び iScan シ ス テ ム で 、 ユ ー ザ ー 操 作 なしでの BeadChip のロードおよびスキャンを実行可能に するため、イルミナでは AutoLoader 2.x をご提供してい ます。 AutoLoader 2.x は継続的な自動運転を可能にし、 スキャナー1台あるいは2台同時にアレイをロードできま す。AutoLoader 2.xにより、スキャナーを最大限に活用でき るようになるため、一週間に数千のサンプル処理の実行、 アッセイ効率の向上および研究費の削減が可能となりま す。 AutoLoader 2.x の設置面積は小さく、デュアルスキャ ナー構成であっても標準的な実験ベンチの上にシステムを設置 できます（図1）。 LIMSによる統合 オプションの統合 Infinium LIMS または GoldenGate LIMS は イルミナ製品用に特別に設計されており、正確なサンプル情 報、ワークフローの遂行およびデータトラッキングを確実なも のにします。イルミナの LIMSは使いやすいカスタムインター フェイス、サンプルトラッキング機能（posID）に加えて、プ ロジェクト全体を管理するためのツールを備えています。 690 mm 1600 mm このようなスキャナーにロボットを加えた機器構成において は、優れた再現性と高いスループットが実現できます。また、 ロボットの均一なピペッティング操作により、オペレーター間 のばらつきを排除することができます。 850 mm iScanシステム2台とAutoloader 2.xを標準的な実験ベンチに設置可能 です。モニターを除くシステムの高さは 510mm です。上記構成に加 え、iScan、HiScan、HiScanSQシステムとAxtoloader 2.xの併設も可 能です。詳しくは弊社担当者までお問い合わせ下さい。 LIMSはワークフロー全体を通してサンプルを確認・追跡し、 アッセイ操作が間違いなく行われるようにします。統合された ツールがサポートするタスクは、同時並行で進めているプロ ジェクトの管理、進捗の追跡およびキューの確認、プロジェク ト・研究責任者・研究機関といった情報のサンプルへの登録が Specification Sheet: Array Instruments あります。通知およびレポートの作成・メール送信といった下 流プロセスは自動的に実行されます。 表4：必要設置条件 LIMS によって管理された完全自動化 HiScan システムまたは iScanシステムは、1日に数百、数千というサンプルを処理す る研究室においてサポートスタッフの負担を軽減し、実験ミス を最小限に抑えます。 モジュール式デザインによって拡大するアプ リケーション 制御コンピューターおよびソフトウェア HiScanシステムおよびiScanシステムには、スキャナーの全機 能を制御するコンピューターワークステーションが含まれてい ます。オートメーション化されたこのシステムは、レーザー制 御、精密機器制御（フォーカスモーターを含む）、励起信号の 検出、画像記録、画像抽出、データ出力の機能を備えています （表 3）。 データ解析をサポートするのは、画像化ツール、高度なデー タ操作機能、および詳細なレポート機能を備えたイルミナの GenomeStudio® ソフトウェアです。GenomeStudioは、各ア プリケーション用のモジュールと共通フレームワークから成り ます。モジュール式の構成を採用したことにより、 HiScanシ ステムおよびiScanシステムは幅広いゲノム解析に対応する真 の多目的装置となり、同時に一貫したユーザー環境と統合解析 のためのツールを提供します。 据付とサポート スキャナー製品のご購入には据付とトレーニングが含まれます。必 要設置条件については表4をご覧下さい。フィールドサービスエン ジニアが据付を完了した後、 フィールドアプリケーションの担当者 がご購入のアレイ製品についてオンサイトでの包括的なトレーニ ングを提供します。継続的なテクニカルサポートもテクニカルサ ポートの担当者が提供します。 仕様 電源 専用サーキット、100∼120または 200∼240VAC、50/60Hz、360VA、 15A（110V）または12A（220V） 空気配管 防振台用に30∼35psi、5µmエレメント フィルター使用のこと 高度2,000 m未満 温度10∼30℃ ● 湿度10∼90% ● 過電圧カテゴリーII ● 動作環境 HiScanシステムはSQモジュールおよびcBot cluster generation システムの追加によるアップグレードで、容易に次世代シーケン スを行えるようになります。このコンパクトなSQモジュールには、 シームレスなペアエンドリードに必要な流路システムを含め、イ ルミナのSequence-by-Synthesis（SBS）ケミストリーを行うた めに必要なコンポーネントが全て搭載されています。これにより HiScanシステムは高い柔軟性を備え、あらゆる研究に適応し、変 化しつづける研究ニーズへの対応も容易です。 パラメーター ● 保証とサービス イルミナはお客様の満足を最優先とする業界最高水準のサ ポート体制を整えています。本システムのご購入には、スキャ ナー、ハードウェア、付属品およびオプションパッケージを対 象とする包括的な12ヶ月保証契約が含まれます。 12ヶ月保証には以下のものが含まれます ・営業時間内でのオンサイトの緊急時サービスコール ・オンサイトの保守点検サービス ・購入したアプリケーションのソフトウェアのアップグレード ・システムの保守または修理用の部品、技術提供および消耗品 ・電話によるサポート 常に最高のパフォーマンスでシステムを稼働していただけるよ う、各種延長保証契約もご用意しております。 まとめ HiScanシステムおよびiScanシステムは、最新のアレイ解析装 置であり、幅広いスペクトルのアプリケーションをサポートし ます。最高のスループットを獲得し、研究結果を得るのにかか る時間を最短化し、さらに次世代シークエンスの容易な導入を はかるためには、 HiScan システムをお選び下さい。 iScan シ ステムは、データ品質および対応アプリケーションの多様性を 損なうことなく、高スループットアレイ解析への手軽なエント リーポイントを提供します。両システムはまた、優れた遺伝子 解析研究の実現のため、お客様のアレイシステムを最大限に活 用していただけるよう、業界最高水準のサポートを提供します。 表3：スキャナーの仕様 パラメーター HiScan iScan 0.375 ミクロン 0.53 ミクロン 532nm および 660nm デュアルレーザー励起 532nm および 658nm デュアルレーザー励起 自動画質解析（非圧縮または圧縮）による TIFF あるいは JPG フォーマット作成 自動画質解析（非圧縮または圧縮）により サイズ（幅 × 高さ× 奥行） 71.9cm×74.5cm×69.9cm 52cm×45cm×66cm 防振台（幅 × 高さ× 奥行） N/A 61cm×6cm×69cm 136kg 65kg ピクセル分解能 レーザー励起 画像ファイル出力 重量 TIFF あるいは JPG フォーマット作成 Specification Sheet: Array Instruments イルミナの遺伝子解析ツールについての詳しい情報は弊社ウェブ サイトwww.illuminakk.co.jpをご覧下さい。 製品情報 製品名 カタログ番号 HiScanシステム、110V/220V SY-103-1001 iScanシステム、110V/220V SY-101-1001 AutoLoader 2.x、シングルスキャナー 構成、110V/220V SY-202-1001 AutoLoader 2.x、デュアルスキャナー 構成、110V/220V SY-202-1002 SQモジュール SY-101-2001 cBot Cluster Generationシステム SY-301-2002 イルミナ株式会社 代理店 〒108-0014 東京都港区芝5-36-7 三田ベルジュビル 22階 Tel (03) 4578 - 2800 Fax (03)4578 -2810 www.illuminakk.co.jp 本製品の使用目的は研究に限定されます。 © 2013 Illumina, Inc. All rights reserved. Illumina, illumina Dx, BaseSpace, BeadArray, BeadXpress, cBot, CSPro, DASL, DesignStudio, Eco, GAIIx, Genetic Energy, Genome Analyzer, GenomeStudio, GoldenGate, HiScan, HiSeq, Infinium, iSelect, MiSeq, Nextera, NuPCR, SeqMonitor, Solexa, TruSeq, TruSight, VeraCode, the pumpkin orange color, the Genetic Energy streaming bases design は Illumina, Inc の商標または登録商標です。 その他の会社名や商品名は、各社の商標または登録商標です。予告なしに仕様を変更する場合があります。 Pub. No. 970-2011-J004 14MAY12