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PMDAの「医薬品副作用データベース」を
用いた副作用リスクの評価
－自社医薬品の副作用リスクのポジショニングへの活用－
（4）JMPを用いた副作用リスクポジショニングの視覚化
山田　雅之1，須々田　寛2
1　キッセイ薬品工業株式会社　臨床開発部
2　田辺三菱製薬株式会社　データサイエンスセンター
本日の構成
• はじめに
• 方法
• JMPによる3種類のグラフ表示
– ドリルダウン付散布図
– ツリーマップ
– セルプロット
• まとめ
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はじめに
• ある副作用のシグナル指標のラインリストが得られ
た際，それらの情報のもつ意味を容易に理解させる
視覚化の方法を示す
• 視覚化にあたり，JMPに標準的に備えられている3
つのグラフ「ドリルダウン付散布図」，「ツリーマップ」
及び「セルプロット」を用いる
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方法
• PMDAの「医薬品副作用データベース」を整形し，解析用に
加工したデータを原データとした（広岡ら）
• この原データを用いて，「間質性肺炎」に対するシグナル指標
を算出し，ラインリストを作成した（澤田ら）
• 本論文で用いたシグナル指標のラインリストに含まれる項目
– 項目名：薬効分類名，医薬品（一般名），報告件数（N），ROR，ROR
95%信頼区間下限（ROR下限），PRR，カイ2乗値
情報の視覚化のために，以下の前処理を行った
1) グラフで薬効分類別のマークを表示できるようにする
2) JMPのラベル機能を使って，グラフに医薬品（一般名）及び
薬効分類名を表示できるようにする
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ドリルダウン付散布図
• ドリルダウン付散布図とは，2つのシグナル指標の
関係を示した散布図に対して，詳細を示すために薬
効分類名や医薬品（一般名）を表示した散布図
散布図は横軸にカイ2乗値を，縦軸にPRRを示した
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散布図
横軸：カイ2乗値，縦軸：PRR
X，Y軸とも対数表示，右上がPRRが高く，カイ2乗値も高い薬剤を示す
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ドリルダウン付散布図
横軸：カイ2乗値，
縦軸：PRR
前頁の散布図の右上を拡大し，薬剤分類を表示した。漢方製剤，抗がん剤が多い。
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ツリーマップ
• ツリーマップ（treemap）は，二次元平面上の領域を入れ子状
に分割することによって，ツリー構造のデータを可視化する手
法
• ツリーマップの有名な例
– 世界のニュース記事をタイル状に並べて閲覧できるnewsmap
• ツリーマップの利点
1) 限られた空間を利用して効率よく情報の視覚化を実現できる
2) 分割された各領域の面積を自由に決められる
全薬剤と，散布図でカイ2乗値とPRRが高い医薬品の多い
薬効分類（漢方製剤，その他の腫瘍用薬）に絞ったツリー
マップを示す
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ツリーマップ（全薬剤）
•
•
グラフ→ツリーマップを選択
サイズにカイ2乗値，色分けにPRR，カテゴリに薬効分類名，及び医薬品
（一般名）を選択
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ツリーマップ（全薬剤）
長方形のサイズ：カイ2乗値，色分け：PRR 白色（低）～赤色（高）
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ツリーマップ（漢方製剤）
長方形のサイズ：カイ2乗値，色分け：PRR 白色（低）～赤色（高）
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ツリーマップ（その他の腫瘍用薬）
長方形のサイズ：カイ2乗値，色分け：PRR 白色（低）～赤色（高）
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ツリーマップ（指標の入れ替え）
長方形のサイズ：PRR，色分け：カイ2乗値 白色（低）～赤色(高)
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セルプロット
• セルプロットは，複数のシグナル指標を同時に表示させるた
めに，横はシグナル指標の数だけ展開され，縦は医薬品名
が展開されたテーブルである
• テーブル内の各四角（セル）が，列の値の範囲や種類に応じ
て色分けされるので，各シグナル指標の大きさが一目で確
認できる
PRR及びカイ2乗値に加えて，薬剤ごとの報告件数，ROR，
ROR95％下限の3つの指標を追加し，全部で5つのシグナル
指標の大きさを色分けしたセルプロットを示す
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セルプロット
•
•
グラフ→セルプロットを選択
応答変数にN，PRR，カイ2乗値，ROR，ROR下限をラベルに医薬品名
を選択
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セルプロット（漢方製剤）
青色（低）～ 赤色（高）
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セルプロット（その他抗腫瘍薬）
青色（低）～ 赤色（高）
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まとめ
• 「特定の副作用が起こった場合，あるいは想定された場合に，
日本で承認された医薬品でこれまでその副作用がどのくらい
報告されて，潜在リスクの可能性は他の医薬品と比べて高
いのか低いのか」等の検討の際に，自発報告された副作用
情報を視覚化・俯瞰することで容易にその情報を把握・理解
できることを示した
• 潜在リスクのポジショニングにおいて，表示するシグナル指
標の選択など留意すべき問題は残っているが，試行錯誤的
な検討を重ねることでノウハウが蓄積されると考えられる
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参考文献
1) Steve Jolly, Using Spotfire to Quickly and Intuitively Analyze Drug Safety
Data，
https://www1.vtrenz.net/imarkownerfiles/ownerassets/709/Jolley%20LS%20For
um%20Oct2010%20Distn.pdf
2) 独立行政法人医薬品医療機器総合機構：デ－タマイニイング手法の導入に関す
る検討結果報告書（平成21年3月），
http://www.info.pmda.go.jp/kyoten_iyaku/file/dm-report20.pdf
3) 広岡禎，山田雅之：PMDAの「医薬品副作用データベース」を用いた副作用リスク
の評価 －自社医薬品の副作用リスクのポジショニングへの活用－ (2) PMDAの「医
薬品副作用データベースの活用，（2012），SASユーザー総会論文集
4) 澤田克彦，重田寛文：PMDAの「医薬品副作用データベース」を用いた副作用リス
クの評価 －自社医薬品の副作用リスクのポジショニングへの活用－ (3)シグナル検
出指標の解説と「間質性肺炎」でのシグナル評価，（2012），SASユーザー総会論文
集．
5) 浜本階生：具体例で学ぶ！情報可視化のテクニック 第3回 ツリーマップによる木
構造の可視化（前編）， http://gihyo.jp/dev/feature/01/visualization/0003．
6) 浜本階生：具体例で学ぶ！情報可視化のテクニック 第4回 ツリーマップによる木
構造の可視化（後編）， http://gihyo.jp/dev/feature/01/visualization/0004．
7) SASインスティチュートジャパン：JMPテクニカルニュース：2012年2月28日号，
http://www.jmp.com/japan/mail/tn201202.shtml．
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