System Integration Pack (SIP)

膨大なベンチマークデータと豊富な納入実績から最適な環境をご提案する
System Integration Pack (SIP)
最新の部材を最速で製品化し、最高の計算機を提供します。
科学技術計算に活用されるコンピュータは、市販のパソコン
に比べると、高い負荷に耐えうる信頼性と安全性が求められ
ます。また研究分野によって必要な性能が異なるため、要求
を満たす最適な製品を選ぶことは困難を極めるものです。
HPC システムズの System Integration Pack (SIP) なら、
お客さまの目的に応じてコンサルティングを行ない、高い
パフォーマンスを実現する製品をご提供することが可能です。
高速な科学技術計算機を求めるお客様さまが抱える課題
課題
1
研究内容にあった提案がほしい！
● 購入しようとしているマシンが自分の計算方法に最適な構成かどうか確証が得られない
● コンピュータは動いているが、最適なパフォーマンスが出ているかわからない
● 障害が発生した場合、迅速な復旧に不安がある
数値解析やシミュレーションなどの計算を効率よく行うためにパフォーマンスを追求することは非常
に大切なことです。しかし、どのような計算方法を選択するかによってシステムの構成も変わるばかりか、
コンピュータが持っている最高のパフォーマンスを得るためには、部材の組み合わせやソフトウェア
の高度なチューニングが必要になってきます。必要なものがわかりにくいだけでなく、万が一の障害
対応まで考慮していくと、膨大な選択肢の中から最適な環境を選び出すのは至難の業です。
課題
2
機種選定から環境作りまで、手間と時間をかけたくない！
● CPU やメモリなど部材の製品サイクルがはやく、最適な製品選定ができない
● 必要な機能がバンドルされておらず、どのオプションを選んでいいかわからない
● 計算を始めるための環境作りに余計な時間と手間がかかる
一般的に使われるパソコンと比べ、科学技術計算に使われるコンピュータはスペックも構成も複雑な
ものが多く、製品サイクルがはやい CPU やメモリなどから要求にあった最適な製品を選定するまで
には時間がかかるものです。また Windows のような誰にでも簡単にインストールやセットアップが
できるものばかりでなく、性能を活かすための機能が標準装備されていないこともあり、すぐに研究・
開発をはじめることができないケースが多く見受けられます。
課題
3
高価な製品だからこそ高い信頼性がほしい！
● 製品サイクルがはやい部材ゆえに、事前検証まで十分に想定されていない
● ベンチマークで得られた性能を、そのまま利用できない製品が多い
● 複雑な構成により、対応窓口が一本化されずに必要な解答がすぐに得られない
高負荷な処理能力が求められる科学技術計算用のコンピュータは、持ちうる性能を最大限に発揮する
ための高い信頼性が求められます。しかし、高い信頼性を得るために行われる事前検証や製品そのもの
のベンチマークは非常に手間のかかるものです。またベンチマークで得られた性能は保証されたもの
ではなく、必要な性能が本当に確保できるかどうかは未知数です。ハードウェアとソフトウェアの
複雑な構成により、問い合わせ先で切り分けできない場面も見られます。
そんな時こそ、System Integration Pack (SIP) をお試しください！
System Integration Pack ソリューション
1
膨大なベンチマークから得られた最高のパフォーマンスをご提供
実務に沿った膨大な数のベンチマークを行うことで、お客さまが求める最高性能のパフォーマンスを引き出し、計算が一刻も
早く完了できる最適なシステム構成をご提案します。各種コンパイラーによるパフォーマンスチューニング、アプリケーション
を含めた総合性能評価、ファイル I/O の最適化など、あらゆる環境で最高性能のパフォーマンスを引き出す体制をワンストップ
でご提供可能です。そのためお客さまの環境をいつでも再現でき、お客さまとの共通認識を持ちながらシステム提案から運用
保守までを一括でサポートしています。
2
機種選定からセットアップまで、すぐに使える環境をご提供
お客さまの研究内容に応じて、OS やネットワークを含めた基本設定からジョブ投入できる状態に環境を整備するセットアップ
までを行ない、
すぐに計算が開始できる環境を整えます。
具体的には NTP (Network Time Procotol) による時刻同期の設定や、
NIS (Network Information Service) によるユーザの一元管理設定、複数のジョブを一括で管理できる Lava のインストール
などが済んでおり、届いたその日から研究・開発に没頭することができます。
3
事前検証と性能評価に基づく高い安定性を約束します
SIP モデルの製品は、実業務で行われる負荷を想定しながら信頼性評価を実施しており、厳しい試験にパスしたものだけを選別
して製品を作り上げています。ハードウェアに関わる性能評価はもちろんのこと、量子化学計算や固体物性解析など具体的に
研究・開発の現場で使われている各種アプリケーションの検証試験も実施しています。検証後は速やかにベンチマーク結果を公開し、
同じ性能を引き出すことが可能なシステム構成のままお求めいただけます。またハードウェア・ソフトウェア双方に精通した
技術者が在籍しており、障害の切り分けから復旧までを迅速に行うサポート体制を作り上げています。
■弊社でセットアップ可能なアプリケーションの一例
■パッケージ内容
OS
・CentOS
・Red Hat Enterprise Linux ( 有償 )
並列ライブラリ
・OpenMPI
※オプション：MPICH 他
※販売時の構成により構成されない場合があります。
ジョブ管理ソフト
・Platform Lava
・IBM Platform LSF ( 有償 )
※オプション：PBS Pro ( 有償 )、OGE ( 有償 ) 他
※販売時の構成により構成されない場合があります。
■標準セットアップ内容
計算科学・量子化学・分子シミュレーション
Gaussian
GAMMES
Molpro
Spartan
NWChem
Q-Chem
PAICS
ABINIT-MP
AMBER
MOLCAS
Gromacs
Lammps
DL_Poly
SYBYL
OS のセットアップ
CentOS または Red Hat Enterprise Linux ( 有償 ) をインストールいたします。
⇒ OS 付属の各種ツールパッケージはフルインストールいたします。また、HPC に最適な OS の各種設定を行います。
( 設定一例 )
・HDD 高速 I/O 設定
・大容量メモリ設定
・リモートログイン設定他
ジョブ管理ソフトのセットアップ
Lava または IBM Platform LSF( 有償 ) をインストールいたします。
⇒主に以下の機能がご利用可能となります。
✓ リソース ( 計算機または CPU, メモリ ,HDD 等 ) 管理機能
✓ ジョブ ( ユーザがジョブ管理システムに投入したコマンド ) を受け付ける機能
✓ ジョブをいつどこで開始するか計画し、実行し、結果を記録・報告する機能
※オプション：PBS Pro( 有償 )、OGE( 有償 ) 他
ネットワークセットアップ
弊社にてネットワーク設定をいたします。
⇒ 納入直後からジョブ投入が可能なように、お客様の環境に合わせて IP アドレス等のネットワークを設定をいたしま
す。
NIS のセットアップ ( ユーザ一元管理 )
NIS (Network Information Service) をインストールいたします。
⇒ ユーザ一元管理が可能となり、ノード毎にユーザ登録等をする必要がないのでとても便利です。
HFSS
NFS のセットアップ ( データ共有 )
NFS (Network File System) をインストールいたします。
⇒ 並列計算に必須のファイルサーバの構築と NFS による共有セットアップをいたします。
マルチフィジックス・多用途アプリケーション
NTP のセットアップ ( 時刻同期 )
NTP(Network Time Protocol) をインストールいたします。
⇒ 計算機で大切な時刻同期を保つために必須の NTP 設定をいたします。
Matlab
Host ノードのシステム二重化設定
各種設定情報、OS のバックアップ設定をいたします。
⇒ 弊社 SIP 製品には、システムディスクに加えてバックアップ用ディスクを搭載しています。万一システムディスクが
故障した場合は、バックアップ用ディスクを挿し替えることで迅速に初期状態に戻すことが可能です。ご要望に応じて
定期バックアップ設定 ( システムディスク中の各種設定情報や OS そのものを定期的にバックアップする設定 ) を承っ
ております。RAID( ミラーリング ) 設定オプションもございます。
■オプションセットアップ内容
計算物理・物性物理・材料・電子構造
CFX
Fluent
Abaqus
Marc
Nastran
Easy5
Dytran
Adams
Patran
STAR-CD
SCRYU/Tetra
STREAM
STAR-CCM+
FrontFlow
OpenFOAM
Phoenics
JMAG
SILVACO 社製品
エレクトロニクス・電磁界解析
Femtet
COMSOL
数式・統計データ理論に関するアプリケーション
Mathematica
R
Maxima
OS・コンパイラー・ミドルウェア
Red Hat
Enterprise Linux
CentOS
Intel Composer
PGI Compiler
Windows 7
Windows Server
2008 R2
PBS Pro
OGE
コンパイラーのセットアップ
インテル ® コンパイラー ( および MKL) をインストールいたします。
・開発環境設定
✓ C/C++ または Fortran のインストール
✓ 数値演算ライブラリ インテル ®MKL のインストール
✓ その他ライブラリ、ツールのインストール
※別途ライセンス費用がかかります。
※ご要望に応じて PGI コンパイラー等のインストールも承ります。
並列ライブラリのセットアップ
OpenMPI をインストールいたします。
・並列計算環境設定
※オプション：MPICH 他
アプリケーションのセットアップ
各種アプリケーションをセットアップいたします。
⇒ 各種アプリケーション、マルチコア対応や GPU 対応アプリケーションが正常動作するようにセットアップします。
科学技術計算や CAE 解析の各種アプリケーションについて社内で
RAID セットアップ
ご利用環境に応じた RAID の構築をいたします。
※構成によっては別途 RAID カードが必要になる場合がございます。
動作検証 ･ 性能確認を行い、環境設定まで含めてセットアップ
CUDA セットアップ
・GPGPU に対応した CUDA Toolkit のインストールおよび動作検証を行います。
しています。ご導入にあたってお手持ちのインプットを使用した
オンサイトセットアップ
お客様のもとへお伺いし、経験豊富な技術者が各種セットアップを行います。
・ラッキング
・ケーブリング
・クラスタリング他
その他設定作業
お客様のご利用環境に応じた設定作業を実施いたします。
⇒ その他の設定作業につきましても弊社で可能な限り対応いたします。
■その他
ターンキーソリューション
ネットワーク、MPI、OS などはすべてお客様の環境に合わせた設定を行い、ターンキーソリューションとして出荷しています。
実行性能の確認
社内での徹底的なテストによる基準性能の達成を出荷前にテストにて確認しています。
ネットワークパフォーマンスチューニング
クラスター機の基礎機能であるネットワーク性能を徹底的なテストにて、常に最高の性能に維持して設定しています。
各種デーモン類の選択と確認
HPC/ クラスター動作に必須の各種デーモンの確認をパラメータレベルでも行っております。
ファームウェア、OS 最適化
ファームウエアと OS のマッチングと最適設定を実施しております。
IBM Platform LSF LAVA
上記は弊社でセットアップ可能なアプリケーションの一例です。
ベンチマークテストも可能です。アプリケーションに合わせて
最適なシステム構成をご提案致します。
■お問い合わせ先
HPC システムズ株式会社
〒 108-0022 東京都港区海岸 3-9-15 LOOP-X 8 階
FAX：03-5446-5550
TEL：03-5446-5531
Mail：[email protected]