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PIWI 80

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PIWI 80
索 引
加齢黄斑変性症
和 文
アカパンカビ
24
アクリルアミド
33
アグロバクテリウム
アダプター
122
40, 50
アデノウイルス
26
アノテーション
66, 70
アバーチン
106
アフィニティークロマトグラフィー
46
アポトーシス
27
アルカリフォスファターゼ処理
53
アンタゴニスト
26
アンチセンス鎖由来
19
維管束
15
遺伝子間領域
イネ
14, 22
118
イミダゾール基
31
いもち病菌
25
医薬品
インターフェロン応答
イントロン構造
ウイルス
ウイルスベクター
126
99, 102
14
15, 26
120
ウェブサイト
67
ウェルシュ菌
28, 29
ウェルチグレープ寒天培地
11, 16
エフェクター複合体
13, 17
エマルジョン PCR
59, 61
エンドソーム
126
黄色ブドウ球菌
28
オーバーハング
99
オフ・ターゲット
99, 120
オペロン
29
オリゴ dT
31
カ行
ガイド分子
18
界面活性剤
49
化学合成アンチセンスオリゴ
化学合成法
核酸化合物
核酸キャリア
各種 RNA の配列
カチオニック・リポソーム
活性予測アルゴリズム
可動因子
カーボランダム
128
RNA 実験ノート 下巻
ショウジョウバエ卵巣抽出液
癌遺伝子
12
小分子 RNA
10
127
10
126
69
101
99
24
122
17, 92, 109
47
10, 33, 66
小分子 RNA 同定
59
幹細胞維持
92
小分子 RNA の可視化
56
カンジダ
25
小分子 RNA の単離
50
感染防御
11
植物
14
12
シロイヌナズナ
癌抑制遺伝子
21, 92
拮抗薬
126
逆転写
40, 42, 54
局所壊死斑
123
22, 118
真菌
24
新規 miRNA 候補
68
スフェロプラスト
25
クオラムセンシング
29
スペーサー配列
71
クラスター
68
スライサー活性
19
クラミジア
28
精原細胞
クローニング
50
ゼブラフィッシュ
クロマチン
16
セミドライ式ブロッティング装置
グラム陽性嫌気性桿菌
29
染色体
11
ゲノムのスキャニング
11
全身移行性
15
ゲノム配列
69
センス鎖由来
原核生物
28
線虫
92
13, 80
34
20
10, 12
顕微注入
109
セントロメア領域
16
顕微注入用ガラス針
110
造血幹細胞
92
46
相同染色体
24
双方的
20
抗体
抗体医薬
高次クロマチン構造
126
16
抗 DIG-AP 標識抗体溶液
79
抗 RNAi 作用
26
コレラ菌
28
110
エピジェネティクス
ショウジョウバエ
24
幹細胞
ア行
126
カロチノイド
サ行
タ行
大核
92
大規模発現解析
71
大腸菌
28
大腸菌膜タンパク質
10
細菌
28
タバコラットルウイルスベクター
サイズマーカー
34
小さな RNA
10
再編成
11
重複領域
23
細胞毒性
102
沈殿用キャリアー
121
51
細胞への導入
99
低分子医薬
126
細胞溶解バッファー
85
低分子化合物
126
サイレンシング
10
テトラヒメナ
92
サイレンシングサプレッサー
15
転移因子
92
サイレンシングシグナル
15
電気泳動
51
作動薬
126
転写後抑制
92
さまざまな RNAi 法の特長
118
転写産物の精製
37
サルモネラ
28
転写抑制
92
三塩基周期性
99
導入効率
102
自己新生
20
動物細胞
17
糸状菌
24
特定分子経路の網羅的解析法
93
次世代シークエンサ
59
トポイソメラーゼ
自然免疫系
26
トマトモザイクウイルス
123
シトシン DNA
25
ドラッグデリバリーシステム
126
子嚢菌
25
トランスフェクション
宿主植物
15
トランスポゾン
24, 26, 28, 67
種の保存
21
トリプレックス
31
小核
92
115
98
ナ行
内在性 siRNA
11, 22
二成分制御系
29
ヌクレオソーム
16
ノーザンブロット
33
ノックダウン
99
ポリ U 化
14
Argonaute の調製
84
翻訳抑制
13
Argonaute siRNA chaperone
16
マ行
バイオインフォマティックス
66
ハイブリダイゼーション
38
ハイブリダイゼーションバッファー
38
ハイブリダイゼーション溶液
78
培養細胞用抗生物質ストック溶液
94
パイロシークエンス法
59
バクテリオファージ
28
反復配列
67
ヒストン H3
16
非対合領域
24
病原遺伝子
28
表層タンパク
29
標的 RNA 切断反応バッファー
84
品質管理
11, 21
ヒト細胞
97
ヒト HeLa 細胞
97
ビオチン
59
ピューロマイシン
98
ピロリン酸
65
フィードバックループ
17
プラナリア
92
プログラム
69
プロタミン
126
ブロッキング溶液
79
ブロッティング装置
33
プローブの調製
80
分泌タンパク
29
分裂酵母
16
ヘアピン型 dsRNA
ヘアピン RNA
ヘアピン RNA ベクター
autoinducing peptide
29
bantam
87
マウスゲノム
69
Basidiomycota
25
BAS–2500
38
106
無機リン酸
15
無血清培地
102
メチル化
免疫
免疫沈降
24
ヘテロクロマチン化
92
ヘマトクリット管
113
ヘルペスウイルス
27
ベンサミアーナ
122
ホスホロアミダイト法
127
ホスホロチオエート
127
母性 mRNA
13
哺乳動物細胞
99
ボラノホスフェート
127
ポリオーマウイルス
27
20
BIOPREDsi
99
Blast
15
blastn
67
blat
67
46, 48, 56, 84
67, 69
Bloomington Stock Center
ヤ行
ユビキチンリガーゼ
15
114
C∼D
C 型肝炎ウイルス
27
CAP analog
ラ行
121
cDNA ライブラリー
ライブラリー
卵黄膜
リアルタイム PCR
リサイクル
50, 60
54, 66
CD34 +
92
114
CEM 法
127
40, 42
Chp1
16
127
CH42
124
リーダー配列
29
cis の作用
16
立体障害
71
cis–antisense
23
リピートの位置情報
69
Clr4
16
10
co–factor
18
co–suppression
24
リプレッサー
リポソーム
126
リモデリング
16
Cryptococcus neoformans
25
緑膿菌
28
CTL 反応
27
リンカー
50
DCL1/2/3/4
22
DCL1–9
14
レトロトランスポゾン
19, 20, 67, 92
レンサ球菌
28
レンチウイルスベクター
103
DCL1–HYL1
14
Dcl-2
24
dcr1
16
DDS
126
DGCR8
欧 文
25
16
bidirectionaly
14
Dicer
118
ヘテロクロマチン
19
71
114
ヘテロカリオン
25
Aubergine
マイクロアレイ
麻酔薬
ハ行
Ascomycota
A∼B
Dicer–like 1
14
Dicer–1
13
Dicing 反応
99
AGO
18, 92
Dictyostelium discoideum
AGO1
15, 16
directional クローニング
AGO3
19
agr システム
28, 29
13
11, 16, 22, 26
25
115
DNA オリゴプローブ
35
DNA ダブルヘリックス
30
AIP
29
DNA プローブ
AP バッファー
79
Drosha
Arc
16
Drosophila Genomics Resource Center 115
Arabidopsis Genomic RNAi
Knock–out Line Analysis
Argonaute
125
11, 13, 16, 18, 24, 84
Argonaute −小分子 RNA 複合体
11
36
11, 13
druggable target
126
dsCheck
120
dsRNA
118
dsRNA 応答性プロテインキナーゼ
118
索引●
129
索
引
DynaExpress miRNA Cloning Kit
51
D–TOPO
114
E∼K
MICB
27
PDS
micRNA
10
PEG Solution
micro RNA
22
P element induced wimpy testis
92
MILI
92
Perl
69
Minimum Free Energy
70
PHO2
EBV
27
miR–BART2
27
phytoene desaturase
emPCR
60
miRBase
12, 41, 71
miR–LAT
27
13, 26
69
miRNA
flamenco
20
miRNA 成熟体
39, 40
FLX システム/454 シークエンサ
59
miRNA 前駆体
39
PIWI
25
GAL4 系統
GAL4–UAS システム
15
124
25
pH1 ベクター
Fasta 形式
Fungal Genetics Stock Center
53
Phytophthora infestans
Exportin 5
10, 11, 12, 14, 18, 22, 30, 40, 66
124
piRNA
103
11, 18, 45, 66, 92
piRNA の配列
69
11, 18, 19, 25
miRNA の配列
69
PIWI サブファミリー
18
114
miRNA の発現解析
77
PIWI ファミリー分子
92
114
miRNA/miRNA *
13
Piwi ホモログ
92
miR–UL112
27
Piwi–interacting RNA
115, 120
miR162
14
PKR
GC 含量
99
miR163
14
PM プローブ
71
GENETYX
67
miR168
14
PNPase
30
114
miR171
15
Polerovirus
15
gypsy
20
miR173
14
poly A 配列
13, 40
G–25 カラム
80
miR390
14, 23
pol Ⅱ型
hCMV
27
miR399
15
pol Ⅲ型
HEN1
14
miR–430
13
precursor miRNA
Hiwi
92
miScript System
hla 遺伝子
29
MIWI
92
primary miRNA
13, 14
Hoogsteen 型
31
MM プローブ
71
pri–miRNA
13, 14
16
Molecular Sex
30
pRISE
HYL1
14
mRNA
30
ProteinaseK 溶液
78
hypochromism
30
mRNA の配列
69
P5CDH
23
Hyponastic Leaves 1
14
MSUD
24
Qde–1
24
Mucor circinelloides
25
Qde–2
24
Myxomycete
25
quelling
24
GammaBind G Sepharose
Gateway system
48
GETDB
HP1
H1 プロモーター
103
H3K9me
16
in vitro 転写
37
intergenic region
14
inverted repeat
25
N∼Q
N 遺伝子
natural–antisense
transcript–derived siRNA
L∼M
LargeT 抗原
27
LAT 遺伝子
27
LB 培地
94
LcJ
120
let–7
18, 41
LgJ
120
lin–4
12, 18
lin–14
12
Lipofectamine2000
102
Lipofectin
25
LNA
77, 127
Locked Nucleic Acid
77, 127
Loquacious
13
meiotic silencing by unpaired DNA
24
Mfold
67
130
RNA 実験ノート 下巻
40, 43
nat–siRNA
123
22
22, 23
79
NCBI Blast
69
Neurospora crassa
25
NK/CTL
27
NKG2D
27
NK 細胞
27
non–druggable target
28, 30
126
NRPD1a
23
OmpF
10
Oomycota
25
Pasha
PAZ
PBST
93
93
13, 19
13, 14, 19
114
R
NBT/BCIP 発色液
non–coding RNA
pre–miRNA
18, 92
26, 118
13
11, 18
78
RandFold
rasiRNA
69
19, 67
RBS
29
rdp1
16
RDRC 複合体
16
RdRP
24
RDR6
RecQ–siRNA
22
127
repeat–associated siRNA
19
ribosome–binding site
29
RISC
11, 13, 22, 24
RITS
16, 25
RNA 依存 DNA メチル化
16
RNA 依存 RNA ポリメラーゼ
16
RNA 干渉
93
RNA サイレンシング
11, 18
RNA の銀染色
56
RNA の性状
57
RNA 分解酵素
11
Single–Stranded Template DNA
RNA ヘリカーゼ
11
siRNA
RNA ポリメラーゼ 6
22
siRNA 医薬
60
10, 15, 18, 22, 30, 66, 99
126
T2 ファージ
31
T4 RNA ligase
50
UAS–dsRNA 系統
114
RNA ポリメラーゼⅡ
14, 16, 22
siRNA の活性
99
unpaired
24
RNA ポリメラーゼⅣ
23
siRNA のデザイン法
99
U6 snRNA
35
RNA ラダープローブ
36
siRNA の導入法
101
VA RNA Ⅰ/Ⅱ
26
RNA ワールド
31
siRNA の濃度
102
VirR/VirS 制御系
29
RNA dependent RNA polymerase
24
siRNA 発現システム
108
VR–RNA
29
siRNA viewer
100
Watson–Crick
30
whole mount in situ
ハイブリダイゼーション
77
X 線回折
30
Zygomycota
25
RNA–directed RNA polymerase complex
16
RNA–induced silencing complex 11, 13, 22
RNA–induced transcriptional silencing
RNA interference
10, 93
RNA polymerase Ⅱプロモーター
RNA polymerase Ⅲ
93
103
RNA polymerase Ⅲプロモーター
RNAi
16
93
10, 16, 18, 26, 93, 109
RNAi 効果の高い siRNA
95
RNAi 阻害作用
26
RNAi トランスジェニックマウス
RNAi の誘導
103
103, 109
RNAi ベクター
114
RNAi ベクターの作製法
103
RNA–RNA 相互作用
RNaseP
RNase Ⅲ
16
31
14, 29
RNase Ⅲ型酵素
11
RNAshapes
69
RNA Ⅲ
28
RNP
rot 遺伝子
rRNA の配列
RSV 感染症
RT–PCR
18
29
69
126
40
S
Sad-1
59
SCF–E3
15
SE
14
12, 13
self–renewal
20
SERRATE
14
SET
short hairpin RNA
short interfering RNA
16
93
18, 22
short temporal RNA
10
shRNA
93
shRNA ライブラリー
93
shRNA 発現ベクター
93
siDirect
siExplorer
11
Slicer 活性の解析
84
Slim mold
25
SMAD3
27
small interfering RNA
10
Sms–2
24
Sms–3
snoRNA
snoRNA の配列
69
snRNA
66
spa 遺伝子
29
SRO5
23
SSCT
79
sstDNA
stem–loop 構造
stRNA
60
13, 14, 68
10
Su
124
sulfur
124
SURE2
117
SUV39H1
16
SV40
27
Swi6
16
SYBR Green
44
SYBR Green Ⅱ
58
S2 細胞
87
95, 99
99
TaqMan プローブ
TAS 遺伝子
ta–siRNA
41
23
14, 22
Tas3
16
TGF– β
27
The AGRIKOLA project
Tm 値
Toluidine Blue
ToMV
trans の作用
trans–acting siRNA
125
40, 82
88
123
16
1– メチルチミン
31
1M リン酸バッファー
38
15 %アクリルアミド/6 M 尿素ゲル
34
2 × SSCT / 25 %ホルムアミド
79
2 × SSCT / 50 %ホルムアミド
2 塩基の突出
79
14, 99
2 本鎖 DNA
30
2 本鎖 DNA–RNA
30
2 本鎖 RNA
30
21U–RNA
50
3 ′非翻訳領域
15
3 本鎖 RNA
31
3 ′末端
14
3 ′リンカーの結合
53
3 ′UTR
12
35S プロモーター
118
4 % PFA / PBS 溶液
78
40 mM NaHCO3/60 mM Na2CO3
37
454 シークエンサ
59
5 ′末端
14
5 ′末端リン酸化
54
5 ′リンカーの結合
54
50 %メタノール/ PBST
81
6 ×ローディングバッファー
51
9– メチルアデニン
31
α溶血毒素
29
γ-32P-ATP
56
Δ 1–pyroline–5–carboxylate
dehydrogenase
23
14, 22
TRBP/PACT
13
tRNA
30
tRNA の配列
69
TRV ベクター
122
T2DNA
数字・その他
24
45, 66
T∼Z
24
Sanger 法
seed 領域
Slicer
31
索引●
131
索
引
Fly UP