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PIWI 80
索 引 加齢黄斑変性症 和 文 アカパンカビ 24 アクリルアミド 33 アグロバクテリウム アダプター 122 40, 50 アデノウイルス 26 アノテーション 66, 70 アバーチン 106 アフィニティークロマトグラフィー 46 アポトーシス 27 アルカリフォスファターゼ処理 53 アンタゴニスト 26 アンチセンス鎖由来 19 維管束 15 遺伝子間領域 イネ 14, 22 118 イミダゾール基 31 いもち病菌 25 医薬品 インターフェロン応答 イントロン構造 ウイルス ウイルスベクター 126 99, 102 14 15, 26 120 ウェブサイト 67 ウェルシュ菌 28, 29 ウェルチグレープ寒天培地 11, 16 エフェクター複合体 13, 17 エマルジョン PCR 59, 61 エンドソーム 126 黄色ブドウ球菌 28 オーバーハング 99 オフ・ターゲット 99, 120 オペロン 29 オリゴ dT 31 カ行 ガイド分子 18 界面活性剤 49 化学合成アンチセンスオリゴ 化学合成法 核酸化合物 核酸キャリア 各種 RNA の配列 カチオニック・リポソーム 活性予測アルゴリズム 可動因子 カーボランダム 128 RNA 実験ノート 下巻 ショウジョウバエ卵巣抽出液 癌遺伝子 12 小分子 RNA 10 127 10 126 69 101 99 24 122 17, 92, 109 47 10, 33, 66 小分子 RNA 同定 59 幹細胞維持 92 小分子 RNA の可視化 56 カンジダ 25 小分子 RNA の単離 50 感染防御 11 植物 14 12 シロイヌナズナ 癌抑制遺伝子 21, 92 拮抗薬 126 逆転写 40, 42, 54 局所壊死斑 123 22, 118 真菌 24 新規 miRNA 候補 68 スフェロプラスト 25 クオラムセンシング 29 スペーサー配列 71 クラスター 68 スライサー活性 19 クラミジア 28 精原細胞 クローニング 50 ゼブラフィッシュ クロマチン 16 セミドライ式ブロッティング装置 グラム陽性嫌気性桿菌 29 染色体 11 ゲノムのスキャニング 11 全身移行性 15 ゲノム配列 69 センス鎖由来 原核生物 28 線虫 92 13, 80 34 20 10, 12 顕微注入 109 セントロメア領域 16 顕微注入用ガラス針 110 造血幹細胞 92 46 相同染色体 24 双方的 20 抗体 抗体医薬 高次クロマチン構造 126 16 抗 DIG-AP 標識抗体溶液 79 抗 RNAi 作用 26 コレラ菌 28 110 エピジェネティクス ショウジョウバエ 24 幹細胞 ア行 126 カロチノイド サ行 タ行 大核 92 大規模発現解析 71 大腸菌 28 大腸菌膜タンパク質 10 細菌 28 タバコラットルウイルスベクター サイズマーカー 34 小さな RNA 10 再編成 11 重複領域 23 細胞毒性 102 沈殿用キャリアー 121 51 細胞への導入 99 低分子医薬 126 細胞溶解バッファー 85 低分子化合物 126 サイレンシング 10 テトラヒメナ 92 サイレンシングサプレッサー 15 転移因子 92 サイレンシングシグナル 15 電気泳動 51 作動薬 126 転写後抑制 92 さまざまな RNAi 法の特長 118 転写産物の精製 37 サルモネラ 28 転写抑制 92 三塩基周期性 99 導入効率 102 自己新生 20 動物細胞 17 糸状菌 24 特定分子経路の網羅的解析法 93 次世代シークエンサ 59 トポイソメラーゼ 自然免疫系 26 トマトモザイクウイルス 123 シトシン DNA 25 ドラッグデリバリーシステム 126 子嚢菌 25 トランスフェクション 宿主植物 15 トランスポゾン 24, 26, 28, 67 種の保存 21 トリプレックス 31 小核 92 115 98 ナ行 内在性 siRNA 11, 22 二成分制御系 29 ヌクレオソーム 16 ノーザンブロット 33 ノックダウン 99 ポリ U 化 14 Argonaute の調製 84 翻訳抑制 13 Argonaute siRNA chaperone 16 マ行 バイオインフォマティックス 66 ハイブリダイゼーション 38 ハイブリダイゼーションバッファー 38 ハイブリダイゼーション溶液 78 培養細胞用抗生物質ストック溶液 94 パイロシークエンス法 59 バクテリオファージ 28 反復配列 67 ヒストン H3 16 非対合領域 24 病原遺伝子 28 表層タンパク 29 標的 RNA 切断反応バッファー 84 品質管理 11, 21 ヒト細胞 97 ヒト HeLa 細胞 97 ビオチン 59 ピューロマイシン 98 ピロリン酸 65 フィードバックループ 17 プラナリア 92 プログラム 69 プロタミン 126 ブロッキング溶液 79 ブロッティング装置 33 プローブの調製 80 分泌タンパク 29 分裂酵母 16 ヘアピン型 dsRNA ヘアピン RNA ヘアピン RNA ベクター autoinducing peptide 29 bantam 87 マウスゲノム 69 Basidiomycota 25 BAS–2500 38 106 無機リン酸 15 無血清培地 102 メチル化 免疫 免疫沈降 24 ヘテロクロマチン化 92 ヘマトクリット管 113 ヘルペスウイルス 27 ベンサミアーナ 122 ホスホロアミダイト法 127 ホスホロチオエート 127 母性 mRNA 13 哺乳動物細胞 99 ボラノホスフェート 127 ポリオーマウイルス 27 20 BIOPREDsi 99 Blast 15 blastn 67 blat 67 46, 48, 56, 84 67, 69 Bloomington Stock Center ヤ行 ユビキチンリガーゼ 15 114 C∼D C 型肝炎ウイルス 27 CAP analog ラ行 121 cDNA ライブラリー ライブラリー 卵黄膜 リアルタイム PCR リサイクル 50, 60 54, 66 CD34 + 92 114 CEM 法 127 40, 42 Chp1 16 127 CH42 124 リーダー配列 29 cis の作用 16 立体障害 71 cis–antisense 23 リピートの位置情報 69 Clr4 16 10 co–factor 18 co–suppression 24 リプレッサー リポソーム 126 リモデリング 16 Cryptococcus neoformans 25 緑膿菌 28 CTL 反応 27 リンカー 50 DCL1/2/3/4 22 DCL1–9 14 レトロトランスポゾン 19, 20, 67, 92 レンサ球菌 28 レンチウイルスベクター 103 DCL1–HYL1 14 Dcl-2 24 dcr1 16 DDS 126 DGCR8 欧 文 25 16 bidirectionaly 14 Dicer 118 ヘテロクロマチン 19 71 114 ヘテロカリオン 25 Aubergine マイクロアレイ 麻酔薬 ハ行 Ascomycota A∼B Dicer–like 1 14 Dicer–1 13 Dicing 反応 99 AGO 18, 92 Dictyostelium discoideum AGO1 15, 16 directional クローニング AGO3 19 agr システム 28, 29 13 11, 16, 22, 26 25 115 DNA オリゴプローブ 35 DNA ダブルヘリックス 30 AIP 29 DNA プローブ AP バッファー 79 Drosha Arc 16 Drosophila Genomics Resource Center 115 Arabidopsis Genomic RNAi Knock–out Line Analysis Argonaute 125 11, 13, 16, 18, 24, 84 Argonaute −小分子 RNA 複合体 11 36 11, 13 druggable target 126 dsCheck 120 dsRNA 118 dsRNA 応答性プロテインキナーゼ 118 索引● 129 索 引 DynaExpress miRNA Cloning Kit 51 D–TOPO 114 E∼K MICB 27 PDS micRNA 10 PEG Solution micro RNA 22 P element induced wimpy testis 92 MILI 92 Perl 69 Minimum Free Energy 70 PHO2 EBV 27 miR–BART2 27 phytoene desaturase emPCR 60 miRBase 12, 41, 71 miR–LAT 27 13, 26 69 miRNA flamenco 20 miRNA 成熟体 39, 40 FLX システム/454 シークエンサ 59 miRNA 前駆体 39 PIWI 25 GAL4 系統 GAL4–UAS システム 15 124 25 pH1 ベクター Fasta 形式 Fungal Genetics Stock Center 53 Phytophthora infestans Exportin 5 10, 11, 12, 14, 18, 22, 30, 40, 66 124 piRNA 103 11, 18, 45, 66, 92 piRNA の配列 69 11, 18, 19, 25 miRNA の配列 69 PIWI サブファミリー 18 114 miRNA の発現解析 77 PIWI ファミリー分子 92 114 miRNA/miRNA * 13 Piwi ホモログ 92 miR–UL112 27 Piwi–interacting RNA 115, 120 miR162 14 PKR GC 含量 99 miR163 14 PM プローブ 71 GENETYX 67 miR168 14 PNPase 30 114 miR171 15 Polerovirus 15 gypsy 20 miR173 14 poly A 配列 13, 40 G–25 カラム 80 miR390 14, 23 pol Ⅱ型 hCMV 27 miR399 15 pol Ⅲ型 HEN1 14 miR–430 13 precursor miRNA Hiwi 92 miScript System hla 遺伝子 29 MIWI 92 primary miRNA 13, 14 Hoogsteen 型 31 MM プローブ 71 pri–miRNA 13, 14 16 Molecular Sex 30 pRISE HYL1 14 mRNA 30 ProteinaseK 溶液 78 hypochromism 30 mRNA の配列 69 P5CDH 23 Hyponastic Leaves 1 14 MSUD 24 Qde–1 24 Mucor circinelloides 25 Qde–2 24 Myxomycete 25 quelling 24 GammaBind G Sepharose Gateway system 48 GETDB HP1 H1 プロモーター 103 H3K9me 16 in vitro 転写 37 intergenic region 14 inverted repeat 25 N∼Q N 遺伝子 natural–antisense transcript–derived siRNA L∼M LargeT 抗原 27 LAT 遺伝子 27 LB 培地 94 LcJ 120 let–7 18, 41 LgJ 120 lin–4 12, 18 lin–14 12 Lipofectamine2000 102 Lipofectin 25 LNA 77, 127 Locked Nucleic Acid 77, 127 Loquacious 13 meiotic silencing by unpaired DNA 24 Mfold 67 130 RNA 実験ノート 下巻 40, 43 nat–siRNA 123 22 22, 23 79 NCBI Blast 69 Neurospora crassa 25 NK/CTL 27 NKG2D 27 NK 細胞 27 non–druggable target 28, 30 126 NRPD1a 23 OmpF 10 Oomycota 25 Pasha PAZ PBST 93 93 13, 19 13, 14, 19 114 R NBT/BCIP 発色液 non–coding RNA pre–miRNA 18, 92 26, 118 13 11, 18 78 RandFold rasiRNA 69 19, 67 RBS 29 rdp1 16 RDRC 複合体 16 RdRP 24 RDR6 RecQ–siRNA 22 127 repeat–associated siRNA 19 ribosome–binding site 29 RISC 11, 13, 22, 24 RITS 16, 25 RNA 依存 DNA メチル化 16 RNA 依存 RNA ポリメラーゼ 16 RNA 干渉 93 RNA サイレンシング 11, 18 RNA の銀染色 56 RNA の性状 57 RNA 分解酵素 11 Single–Stranded Template DNA RNA ヘリカーゼ 11 siRNA RNA ポリメラーゼ 6 22 siRNA 医薬 60 10, 15, 18, 22, 30, 66, 99 126 T2 ファージ 31 T4 RNA ligase 50 UAS–dsRNA 系統 114 RNA ポリメラーゼⅡ 14, 16, 22 siRNA の活性 99 unpaired 24 RNA ポリメラーゼⅣ 23 siRNA のデザイン法 99 U6 snRNA 35 RNA ラダープローブ 36 siRNA の導入法 101 VA RNA Ⅰ/Ⅱ 26 RNA ワールド 31 siRNA の濃度 102 VirR/VirS 制御系 29 RNA dependent RNA polymerase 24 siRNA 発現システム 108 VR–RNA 29 siRNA viewer 100 Watson–Crick 30 whole mount in situ ハイブリダイゼーション 77 X 線回折 30 Zygomycota 25 RNA–directed RNA polymerase complex 16 RNA–induced silencing complex 11, 13, 22 RNA–induced transcriptional silencing RNA interference 10, 93 RNA polymerase Ⅱプロモーター RNA polymerase Ⅲ 93 103 RNA polymerase Ⅲプロモーター RNAi 16 93 10, 16, 18, 26, 93, 109 RNAi 効果の高い siRNA 95 RNAi 阻害作用 26 RNAi トランスジェニックマウス RNAi の誘導 103 103, 109 RNAi ベクター 114 RNAi ベクターの作製法 103 RNA–RNA 相互作用 RNaseP RNase Ⅲ 16 31 14, 29 RNase Ⅲ型酵素 11 RNAshapes 69 RNA Ⅲ 28 RNP rot 遺伝子 rRNA の配列 RSV 感染症 RT–PCR 18 29 69 126 40 S Sad-1 59 SCF–E3 15 SE 14 12, 13 self–renewal 20 SERRATE 14 SET short hairpin RNA short interfering RNA 16 93 18, 22 short temporal RNA 10 shRNA 93 shRNA ライブラリー 93 shRNA 発現ベクター 93 siDirect siExplorer 11 Slicer 活性の解析 84 Slim mold 25 SMAD3 27 small interfering RNA 10 Sms–2 24 Sms–3 snoRNA snoRNA の配列 69 snRNA 66 spa 遺伝子 29 SRO5 23 SSCT 79 sstDNA stem–loop 構造 stRNA 60 13, 14, 68 10 Su 124 sulfur 124 SURE2 117 SUV39H1 16 SV40 27 Swi6 16 SYBR Green 44 SYBR Green Ⅱ 58 S2 細胞 87 95, 99 99 TaqMan プローブ TAS 遺伝子 ta–siRNA 41 23 14, 22 Tas3 16 TGF– β 27 The AGRIKOLA project Tm 値 Toluidine Blue ToMV trans の作用 trans–acting siRNA 125 40, 82 88 123 16 1– メチルチミン 31 1M リン酸バッファー 38 15 %アクリルアミド/6 M 尿素ゲル 34 2 × SSCT / 25 %ホルムアミド 79 2 × SSCT / 50 %ホルムアミド 2 塩基の突出 79 14, 99 2 本鎖 DNA 30 2 本鎖 DNA–RNA 30 2 本鎖 RNA 30 21U–RNA 50 3 ′非翻訳領域 15 3 本鎖 RNA 31 3 ′末端 14 3 ′リンカーの結合 53 3 ′UTR 12 35S プロモーター 118 4 % PFA / PBS 溶液 78 40 mM NaHCO3/60 mM Na2CO3 37 454 シークエンサ 59 5 ′末端 14 5 ′末端リン酸化 54 5 ′リンカーの結合 54 50 %メタノール/ PBST 81 6 ×ローディングバッファー 51 9– メチルアデニン 31 α溶血毒素 29 γ-32P-ATP 56 Δ 1–pyroline–5–carboxylate dehydrogenase 23 14, 22 TRBP/PACT 13 tRNA 30 tRNA の配列 69 TRV ベクター 122 T2DNA 数字・その他 24 45, 66 T∼Z 24 Sanger 法 seed 領域 Slicer 31 索引● 131 索 引