has properties

DICOM構造化
レポートの利用
Andrei Leontiev
Dynamic Imaging
JIRA DICOM委員会(森村 晋哉)
DICOM構造化レポート
„
構造化された観察の符号化方法
– 普遍的な仕組み
„
一般的な利用
– 基本テキストSR, 拡張SR, 包括的SR
„
専門的な利用
– キーオブジェクト選択
– CAD, 超音波計測, …
– 関連する患者情報の検索
構造化レポートの
符号化方法
SRの目的
• 画像機器で計測をサポートしたい
• 個人や装置の枠を超えた、共同的な
レポートを作成したい
„ キー画像とリンクさせたい
„ 画像や波形上の関心領域とリンクしたい
„ テンプレートに従って、内容や構造を作
成したい
簡単なSRの例
„
„
„
簡単な診断レポートの例を示す
多レベルの構造
テキスト、符号、画像へのポインタ
Do cu me nt R oot N ode C ONTA IN ER
"Ch es t X-r ay" (Do cumen t T itle)
Leaf Nod e COD E
"V iew s = PA a nd L ateral "
has co ncept m od
conta ins
contain s
Leaf Nod e IM AG E
"Bas el ine "
He ading No de
CONTA INER
"Co nc lu sions"
contain s
Co nten t No de COD E
"fin din g = mass"
contains
He adi ng No de
CONTA INER " Specific
Ima ge Fin din gs "
has pro perties
has properties
conta ins
conta ins
Leaf Nod e NUM
"diam eter = 1.3 cm"
Leaf Nod e COD E
"m argi natio n = infiltrative"
Co nten t No de COD E
"conc lusion = probab le
malig nanc y"
Co nten t node SCO ORD
"bes t il lustra tion o f
fin dings "
inferred f rom
inferred f rom
selected f ro m
Ha s obs co ntext
Co nt en t No de PN AME
"Re co rding Observer =
Smith^John^^Dr ^"
Leaf Nod e IM AG E
Ha s obs co ntext
Co nten t No de U IDRE F
"Study Ins tance UID of
Evi de nc e Dir ec tl y Exa min ed
by RO = 1.2.3.4.5.6.7.100 "
Ha s obs co ntext
Co nten t No de PN AME
"Patie nt-Da ta- Ac quisition
Subj ec t = Ho mer^J ane^^^"
* Re latio ns hi p M odes
= B y-val ue
= B y-reference
胸部X線のレポート (後方と側面ビュー)
患者名 Jane Homer
検査番号 123456
記録者 Dr. John Smith
直径が1.3 cm の浸潤性の周辺部を持つ腫瘍を認める.
基底画像は
QuickTime™ and a
TIFF (LZW) decompressor
are needed to see this picture.
(クリックして表示)
結論
結論は、腫瘍の周辺部が浸潤している事、および、所見を適切に裏付
ける外観から推測すると、悪性である可能性が大きい。
特定の画像所見
所見を最もよく説明する画像は
QuickTime™ and a
TIFF (LZW) decompressor
are needed to see this picture.
(クリックして表示)
胸部X線
概念修飾子は Views=PA and Lateral
記録観察者=Smith^John^^Dr^
検査インスタンスUID …=1.2.3.4.5.6.7.100
患者データ収集主体=Homer^Jane^^^
所見(Finding)=腫瘍
特性は 直径=1.3 cm
特性は 周辺部=浸潤性あり (1.4.2)
基底画像
結論
結論=悪性の可能性が大
1.4.2より推測される
1.7.1より推測される
特定画像の所見
所見を最も良く示す画像(1.7.1)
.
“contains” 関係は示されていない
胸部X線
has concept modifier Views=PA and Lateral
Recording Observer=Smith^John^^Dr^
Study Instance UID …=1.2.3.4.5.6.7.100
Patient-Data-Acquisition-Subject=Homer^Jane^^^
Finding=Mass
has properties diameter=1.3 cm
has properties margination=infiltrative (1.4.2)
Baseline Image
Conclusions
conclusion=probable malignancy
inferred from 1.4.2
inferred from 1.7.1
Specific Image Findings
best illustration of findings(1.7.1)
概念名/値-対を使っている
Chest X-Ray
has concept modifier Views=PA and Lateral
Recording Observer=Smith^John^^Dr^
Study Instance UID …=1.2.3.4.5.6.7.100
Patient-Data-Acquisition-Subject=Homer^Jane^^^
Finding=Mass
has properties diameter=1.3 cm
has properties margination=infiltrative (1.4.2)
Baseline Image
Conclusions
conclusion=probable malignancy
inferred from 1.4.2
inferred from 1.7.1
Specific Image Findings
best illustration of findings(1.7.1)
ヘッディングには値をとらない概念名が使われる
(コンテナ)
Chest X-Ray
has concept modifier Views=PA and Lateral
Recording Observer=Smith^John^^Dr^
Study Instance UID …=1.2.3.4.5.6.7.100
Patient-Data-Acquisition-Subject=Homer^Jane^^^
Finding=Mass
has properties diameter=1.3 cm
has properties margination=infiltrative (1.4.2)
Baseline Image
Conclusions
conclusion=probable malignancy
inferred from 1.4.2
inferred from 1.7.1
Specific Image Findings
best illustration of findings(1.7.1)
画像や空間座標を参照するには、値を持たない
概念名が使われる
Chest X-Ray
has concept modifier Views=PA and Lateral
Recording Observer=Smith^John^^Dr^
Study Instance UID …=1.2.3.4.5.6.7.100
Patient-Data-Acquisition-Subject=Homer^Jane^^^
Finding=Mass
has properties diameter=1.3 cm
has properties margination=infiltrative (1.4.2)
Baseline Image
Conclusions
conclusion=probable malignancy
inferred from 1.4.2
inferred from 1.7.1
Specific Image Findings
best illustration of findings(1.7.1)
コンテクストの継承
„
観察(Observation)コンテクスト
– 複合IODの最上位レベルの属性を含む
– ルートノードのCONTAINERに所属させてよい
– 値による関係では、継承される
– 参照による関係では、継承されない
– 子ノードでは拡張できる (ただし、置換は不可)
– CONTAINERに限らず、任意のコンテントアイテム
に所属させてよい
一般患者モジュール:
“患者姓名”=“Homer^Jane^^^”
“患者ID”=“234567”
“患者の性別”=“F”
“患者の生年月日”=“19991109”
包括的SRの
SOPインスタンス
一般検査モジュール:
“受付番号”=“123456”
“検査ID”=“345678”
“胸部X線”
Context
Context
Context
Contains
“記録観察者”=“Smith^John^^Dr^”
“検査インスタンスUID ...”=“1.2.3.4.5.6.7.100”
“… 画像収集主体”=“Homer^Jane^^^”
“所見”=“Mass”
“胸部X線”
Context
Context
Context
Contains
“記録観察者”=“Smith^John^^Dr^”
“検査インスタンスUID ...”=“1.2.3.4.5.6.7.100”
“… 収集対象の主体”=“Homer^Jane^^^”
“所見”=“腫瘍”
Properties
Properties
Contains
Contains
“基本”=
Modifier
“周辺部”=“浸潤性あり”
Inferred
From
QuickTime™ and a
TIFF (LZW) decompressor
are needed to see this picture.
“結論”
Contains
Contains
“直径”=“1.3” “cm”
“結論”=“悪性の可能性大”
“特定画像の所見”
Contains
“所見をよく裏づける画像”=
Selected
From
“撮影方向”=“PA and Lateral”
Inferred
From
“産科の超音波”
Obsn Context
Contains
“胎児の母親”=“Homer^Jane^^^”
“胎児の所見”
Obsn Context
Properties
“胎児の識別子”=“胎児A”
“妊娠週数”=“16” “週”
Infd From
Contains
“胎児の所見”
Obsn Context
Properties
“BPD”=“27” “mm”
*Biparietal Diameter(児頭大横径)
“胎児の識別子”=“胎児B”
“妊娠週数”=“16” “週”
Infd From
“BPD”=“28” “mm”
SRの利用
3つの基本SRクラス
„
３種の基本SRクラスが定義されており、
任意タイプの構造化された情報の符号化
が可能:
– 基本テキストSR
– 拡張SR
– 包括的SR
„
サポートされる値タイプとノード間の関係
に依って分類される
SRのテンプレート
„
„
特殊化された利用に最適な構造を定義する為、
DICOMではテンプレートを定義している
テンプレートは以下の対象に適用できる:
– 汎用のSOPクラス(基本テキストSR, 拡張SR, 包括
的SR)
– 特殊化されたSOPクラス(マンモCAD, 胸部CAD）
„
拡張が可能なテンプレートと拡張が不可能な
テンプレートがある
テンプレートの凡例
値タイプ
CONTAINER, NUM,
CODE, IMAGE …
値タイプ
概念名 = 値
関係
関係
値タイプ
概念名 = 値
値タイプ
概念名 = 値
概念名とタイプがCODEである値は三つ組
• 符号値
• 符号系名
• 符号意味 (実は,ユーザに意味を伝えるあるテキスト)
典型的な最上位レベル
テンプレート構造
CONTAINER
Document Title
…
CONTAINER
…
TID 1002
観察(Observation)
テンプレートで定義されたタイトル
OB-GYN, Adult Echo, IVUS
Ultrasound Vascular, Cath/Hemo …
CONTAINER
Patient
Characteristics
CONTAINER
Summary
CONTAINER
CONTAINER
CONTAINER
Findings
Finding
Heading
FindingHeading
Heading
…
…
…
コンテクスト
…
他のコンテクスト
例えば処置
所見の要約 複数の所見
ドキュメントのヘディング
CONTAINER
Document Title
ヘディングで子ノードの所見に
共通の意味を持たせて良い
含む
CONTAINER
Heading
限定的: “Exercise Challenge (運動負荷)”
一般的: “Findings(所見)”
概念修飾子を持つ
CODE
…
所見
概念修飾子
“左右の別” = “左”
“所見部位” =
“Cerebral Vessels
(脳血管)”
離散的な数値所見
箇条書き的な表現
CONTAINER
Group
has concept modifier
CODE
Modifier Concept
contains
NUM
Measurement
直径、面積、体積、血流速度、
指標、比、時間経過、…または、
あらかじめ調整された概念: BPD, FL …
has concept modifier
CODE
Modifier Concept
左右の別、所見のある部位、解剖学
的部位の修飾子、心臓の位相、…
DX レポート
• DICOM SRに基づく
• 転書する必要がない:
- 計測
- 画像とのリンク
- 構造化された中身
• 画像生成ワークフロー
と統合されている
• XML表現と親和性がよ
い
• 電子カルテEPR(HL7)
に容易に出力可能
単純な構造に
Observation
Context
Document Title
1
1-n
CONTAINS
Observation
Context
Section Heading
0-1
CONTAINS
0-n
0-n
Report Text
Coded Entry
INFERRED
INFERRED
0-n
0-n
Image Reference
•
•
•
Image Reference
0-n
Image Reference
最小の構造: 符号化されたタイトルとヘディング
レポートの特定のセクションから画像と完全にリンクを行なう
観察コンテクスト(who, what, when)はセクションに分けてよい
計測値を追加する
Document Title
HAS OBS
Observation
Context
1
1-n
CONTAIN
Section Heading
HAS OBS
Observation
Context
0-1
CONTAIN
0-n
0-n
Report Text
Image Reference
Measurement
INFERRED
0-n
Image Reference
0-n
0-n
Coded Entry
INFERRED
0-n
Measurement
0-n
Image Reference
0-n
Measurement
単純な画像レポートに、計測値を追加しただけ
エビデンス文書
エビデンス文書
„
計測値と符号データ
– DICOM SR文書
„
„
„
収集モダリティ、または、ワークステー
ションのどちらかで作成される
画像収集中、または、後処理のワーク
フローで作成される
画像と同等の扱いで参照される
エビデンス文書の例
„
„
„
„
„
„
マンモグラフィーCAD
胸部CAD
超音波産婦人科計測
超音波血管計測
経血管的な結果Vascular Intervention Results
心臓エコー計測
代表的な超音波SR
„
„
„
汎用のSR SOPクラスに基づき
計測値と所見、および、それらの関係を
正確に伝えることを目的とする
特殊化された“レポート”は独自のテンプ
レートを使用する
血管レポートの階層
ドキュメントタイトル
セクションのヘディング
グループ
CONTAINER
Vascular Report
contains
CONTAINER
Findings
has concept modifier
contains
CONTAINER
Anatomy
has concept modifier
CODE
Laterality
CODE
Topographical Modifier
contains
NUM
箇条書き所見
Measurement
最低限の概念
特性
キーオブジェクト選択文書
(KOSD)
„
„
„
„
キー画像への注釈を簡便に行ないたいと
の要望から発案された
汎用の“目録(manifest)” – 画像(さらには
特定のフレーム)へのポインタの集合とし
て開発される
短い文の注釈で、それが選択された目的
を明示する
テンプレートは拡張できない
主治医向け
Here you can see the
renal osteopathy.
教育向け
Fibroosteoclasia
Note2
Note3
主治医向け
主治医向け
主治医向け
This is the hematoma.
Here you can
see the
renal rupture.
Hematoma everywhere
Note1
画像ごとに別の注釈
Note1
for refering physician
Here you can see the
renal rupture.
Note2
for refering physician
This is the hematoma.
画像に共通な注釈
Note3
for refering physician
Hematoma everywhere
Note3
for refering physician
Hematoma everywhere
Note3
for refering physician
Hematoma everywhere
Note3
for refering physician
Hematoma everywhere
KOSDのタイトルはコードである
コード
注釈のタイトルによって重要性の理
由を定義する
興味ある画像
画質が悪いので採用しなかった
担当ベンダー向け
手術向け
キー画像注釈は、コードでの検索
が可能
教育向け
コンファレンス向け
治療向け
患者向け
ユーザのコメントは正規な扱いがさ
れない
対向レビュー向け
研究向け
品質に問題あり
レポート
キー画像注釈
„
KOSDの主な用途は、送信する画像に
«電子的なポストイットpost-it™»を添付:
– 検査での特徴的なイベント
– 画質に問題がある
– コンサルティング
„
KOSDはサーバに保存して、後で読み出
す事が可能
SRオブジェクトのワークフロー
ヘッダ:
レポートタイプ:
所見:
産婦人科
…..
エビデンス文書
BPD
...
…..
診断
ヘッダ:
放射線部レポート
レポートタイプ:
産婦人科
…..
所見:
BPD
...
…..
根拠:
Gestational
Age
...
参照画像:
参照画像:
キー画像注釈
DXレポート
SRの内容に対する検索
患者情報の検索
„
„
„
任意の患者情報を取得可能な基本検索
(明示されたテンプレートを使って、SCPが
応答を作成可能な場合)
患者に関連する情報をHISなどから取得
する場合に有用である
モダリティや他のDICOM対応装置で使用
する事を目的とする
患者情報の検索
„
少なめの照合キー:
– 患者姓名
– 患者ID
– テンプレート識別子
„
患者に関連のある情報を(例えばHISか
ら)取得する場合に有効である
患者情報の検索
„
この目的の為にいくつかのテンプレート
が準備されている
– 汎用の関連する患者情報
– 乳房画像に関連する患者情報
ご質問はありませんか?