ゲル画像解析ソフトウェア - Bio-Rad

ゲル画像解析
ソフトウェアの概要
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ゲル画像解析ソフトウェア
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ソフトウェアの概要
www.bio-rad.com/bioinformatics
ソフトウェアの概要
See Also
バイオ･ラッドは画像撮影、画像解析、データ管理など実験室における様々なニーズに応えるためのソフトウェアを提供しています。
画像解析装置：
P.286
いくつかの画像解析用ソフトウェアは、最適な画像を取得するための撮影機能も兼ね備えています。画面に現れるウィザードや、クイッ
クガイドを利用することで誰でも簡単迅速に表示を最適化し、画像を印刷することができます。
Bio-Plex Manager
ソフトウェア：
P.315
これらのソフトウェアはWindows／MacOSの両方に対応しており、ツールバーやプルダウンメニューなど使いやすいグラフィカルな
インターフェイスを持っています。
For More Information
Web: www.bio-rad.com/imageanalysisSW
Request or download bulletin: 6126
ソフトウェアアプリケーションガイド
Gel Analysis
Image Lab™
P.297
Quantity One®
P.298
PDQuest™
P.298
画像検出
◦
◦
ー
自動解析
◦
◦
◦
1次元電気泳動ゲル解析
◦
◦
ー
コロニーカウンティング
ー
◦
ー
ドット／スロット・ブロット解析
ー
◦
ー
2次元電気泳動ゲル解析
ー
ー
◦
ゲルの切出し（EXQuest使用）
ー
◦
◦
米国FDA 21 CFR Part 11対応ツール
ー
◦
◦
コントロール可能な機種
GelDoc EZ
◦
ー
ー
GelDoc XR Plus
◦
◦*
ー
ChemiDoc XRS Plus
◦
◦*
ー
ChemiDoc MP
◦
ー
ー
PharosFX / PMI
△
◦
ー
GS-800
ー
◦
ー
EXQuest
ー
◦
◦
*オプション　△ 解析のみ対応可能
解析ソフトウェアに必要なシステム条件
Component
Quantity One and PDQuest
Operating system
Windows XP Pro SP3
Mac OSX 10.5
Processor
Intel 2.0 GHz; Pentium 4, dual core or better (Windows);
Core 2 Duo 2.0 GHz or higher (Mac)
Intel 2.0 GHz; Pentium 4, dual core or better (Windows);
Core 2 Duo 2.0 GHz or higher (Mac)
Hard disk space
Minimum ＞20 GB; recommend ≧100 GB
Minimum ＞20 GB; recommend ≧100 GB
System memory (RAM)
Minimum 1 GB; recommend ≧2 GB
Minimum 1 GB; recommend ≧2 GB
Screen resolution
1024 x 768 or higher (Windows); 128 MB video RAM
1280 x 1024 or higher (Mac); 128 MB video RAM
1024 x 768 or higher (Windows); 128 MB video RAM
1280 x 1024 or higher (Mac); 128 MB video RAM
USB port
1 free USB 2.0 port
2 free USB 2.0 ports; 4 USB ports recommended
—
1 USB 1.0 or better or parallel port (Windows)
1 USB 1.0 or better or Mac ADB port
Quantity One HASP dongle
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Image Lab
Windows XP Pro SP3 or Windows 7 (32- or 64-bit);
Mac OSX 10.6
ゲル画像解析
ゲル画像解析ソフトウェア
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ゲル画像解析ソフトウェア
Image Lab™ ソフトウェア
Image Labソフトウェアは電気泳動ゲルやブロッティングメン
ブレンから画像データを取得し、自動解析することができます。
こ の ソ フ ト はGelDoc EZゲ ル イ メ ー ジ ャ ー、GelDoc XR Plus、
ChemiDoc XRS Plus、ChemiDoc MPの4つのシステムを制御す
ることができます。
各装置の中にサンプルを設置した後は、簡単な操作のみで撮影
条件が自動的に最適化された画像が得られます。あらかじめ設
定しておけば、撮影と同時にバンドを検出、分子量を解析し、
レポートの作成までを全自動で実行できます。
Image Labソフトウェアを使用した簡単なプロ
トコールセットアップ
Image Labには詳細なチュートリアルがインストールされてい
るため、撮影経験がなくても必要最小限のトレーニングで撮影
と解析を行うことができます。
すべての操作が自動化対応
●● マウスをワンクリックするだけで、画像撮影から各種解析、
レポート表示までを自動的に行うことができます。撮影条件
を保存しておけば、いつでも条件を呼びだして同じ条件で撮
影することが可能です。
●● 画像撮影や解析のステップを自動化することで、結果を得る
撮影範囲を指定するだけで、自動的に焦点が合
う革新的なアルゴリズムを採用
までの時間を節約します。
●● 個人差が出にくく、高い再現性が得られます。
撮影条件の最適化
●● 各種検出手法に最適な撮影条件があらかじめプリセットされ
ており、プルダウンメニューから手法を選択するだけで設定
が完了します。
●● 撮影範囲を指定するだけで自動的に焦点が合う特別なアルゴ
リズムを搭載し、ピント調整は不要です。
●● フラットフィールディング機能により、光源の影響やレンズ
のゆがみを補正します。
データ解析
●● 画像解析のすべてのステップを自動化することができます。
データ解析／レポート
解析結果の表示と表示内容の選択
See Also
●● ゲルの解析を実行したり、解析パラメータの変更を行ったり
バンド検出やバックグラウンド補正レベルを再調整したい時
にはマニュアル操作にて解析を行うことも可能です。
すると、バンドとレーンの情報、画像情報などがレポート形
式で表示されます。
●● マニュアル操作でパラメータを調整すると、画像上にすぐに
●● 得られた解析データはPDFファイルやExcelファイルなど複数
変更が反映されます。
●● 分子量または塩基対の計算、サンプルの純度計算、各バン
ドの濃度定量などの解析結果を画面上に表示することがで
きます。
の形式で保存可能です。
画像解析装置：
P.286
EXQuestスポット
カッター：
P.294
電気泳動システム：
P.155
●● 画像の表示形式変更や、表示する項目の設定、テキスト情報
付加などを行う便利なツールが搭載されており、論文やプレ
ゼンテーション用のデータを簡単に作成することができます。
For More Information
Web: www.bio-rad.com/imagelabsoftware
Ordering Information
カタログ番号
品名
170-9690
Image Lab ソフトウェア
価格
¥100,000
ゲル画像解析
297
ゲル画像解析ソフトウェア
www.bio-rad.com/bioinformatics
Quantity One® 1-D 解析ソフトウェア
See Also
画像解析装置：
P.286
EXQuestスポット
カッター
P.294
タンパク質電気泳動
システム：
P.155
DNA電気泳動
システム：
P.254
Quantity Oneはバイオ･ラッドのイメージング装置のコントロール、画像の取込み、最適
化、解析を行うことができるソフトウェアです。
Quick Guideに従って解析すれば、定量解析、分子量解析、コロニーカウンティングなど
を簡単に行えます。
さらに自動スポット切出し装置EXQuestをコントロールすることが可能で、解析データ
をそのまま利用して興味のあるバンドだけを素早く切り出すことができます。
異なる画像を最大3枚まで色を変えて重
ね合わせ表示可能
主な機能
●● バイオ･ラッドのいくつかのイメージング装置の撮影から解析まで1つのソフトウェア
で実行可能。
●● 定量解析および分子量解析が可能。
●● コロニーの自動検出を行い、White/Blueなどの色調を識別して個別にカウント。
●● 解析した結果はテキストファイルとして、画像はTIFFやJPEG形式で出力。またTIFF形
式のファイルであれば読み込んで解析することが可能。
●● 化学発光バンドと可視スタンダードのように撮影条件の違う画像を1つのイメージ上で重ね
合わせた合成イメージを作成可能。
●● 各種ウェル数に対応したマクロアレイの定量解析が可能。
●● セキュリティ対応（オプション／Windows版限定）
コロニーカウンティング
Ordering Information
カタログ番号 品名
価格
ー
Quantity Oneソフトウェア
※
170-9615 Quantity One CFRセキュリティーモジュール ¥500,000
CFR Part11に対応可能。
For More Information
Web: www.bio-rad.com/quantityone
Request or download bulletin: 3002
※マークはお問い合わせください。
PDQuest™ 2-D 解析ソフトウェア, Version 8.0
See Also
2次元電気泳動：
P.155
プロティアンi12
システム：
P.175
バッファー、試薬類
P.209
EXQuestスポット
カッター：
P.294
PDQuestは2次元電気泳動ゲルイメージを複数枚同時に解析するためのソフトウェアです。2次元電気泳動ゲルイメージの解析とデー
タ管理を快適に行うための機能が搭載されています。
精巧に設計された解析ツールは、ゲル間の微妙な差異も検出することが可能で、例えばヒートショック、培養条件検討、刺激応答、
経時変化などを研究するのにとても有効です。
画面に表示されるウィザードをクリックしていくだけで、スポットの検出
から発現量比較解析までを簡単に行うことができます。スポット検出は
Gaussian Fitting（正規分布近似）によって行われており、正確に発現量比較
解析を行うことができます。
フレキシブルなライセンス
解析を迅速に行うための機能をすべて盛り込んだAdvancedライセンスと、必
要な機能だけに絞り込んだBasicの2系統のライセンスをご用意いたしました。
Advancedではイメージワーピングを行うことによりBasicよりも高いオート
マッチングレート（一致率）を得ることが可能なだけでなく、ディファレンシャ
ルを視覚的に認識することができます。
For More Information
Web: www.bio-rad.com/pdquest
Request or download bulletin: 3121
実験ウィザード（上）とイメージワーピングを使ったマル
チチャンネルビュー（下）
PDQuest AdvancedとBasicの機能一覧
298
機能
Advanced
Basic
最大解析枚数
無制限
15枚
解析ウィザード
◦
◦
解析プロトコールの繰返し利用
◦
ー
自動スポット検出
◦
◦
オートマッチング
3step
2step
イメージワーピング
◦
ー
マルチフルオレッセンスゲル（DIGE）の解析
◦
ー
スポット切出し装置のコントロール
◦
◦
ゲル画像解析
Ordering Information
カタログ番号
170-9630JA
170-9645
170-9620JA
170-9660JA
170-9670JA
品名
価格
PDQuest Advancedソフトウェア
¥1,800,000
PDQuest CFRセキュリティモジュール
¥950,000
PDQuest Basicソフトウェア
¥980,000
PDQuestアップグレード 7.X to 8.0 BASIC
¥350,000
PDQuestアップグレード 7.X to 8.0 ADVANCED ¥1,000,000
解析に必要なコンピューターの仕様等はお問い合わせください。