...

日本微生物資源学会第 13 回大会プログラム・要旨

by user

on
Category: Documents
9

views

Report

Comments

Transcript

日本微生物資源学会第 13 回大会プログラム・要旨
Microbiol. Cult. Coll. June 2006. p. 49-70
Vol. 22, No. 1
日本微生物資源学会第 13 回大会プログラム・要旨
会
期:平成 18 年 6 月 19 日(月)∼ 21 日(水)
場
所:独立行政法人理化学研究所 鈴木梅太郎記念ホール(講演・総会)
埼玉県和光市広沢 2-1 (電話:048-462-1111)
(すべての行事は理研キャンパス内で行われます.6 月 19 日の行事はすべて統合支援施設,20 日,21
日は鈴木梅太郎記念ホールで開催されます.また,懇親会は広沢クラブで行われます.詳しくは理研
ホームページ(http://www.riken.jp/)
,最初のページの「交通・問い合わせ」中の「交通」を選び,和光
本所を選択すれば,理研までの道順,キャンパス内の地図がご覧いただけます.)
大会事務局:独立行政法人理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室
日本微生物資源学会第 13 回大会事務局 (電話:048-467-9564)
日程
各種委員会
6 月 19 日(月)場所:
(独)理化学研究所 統合支援施設大会議室東側
10:00 ∼ 12:00 理事会 13:00 ∼ 14:30 実務担当者会議 テーマ「文書管理について」
14:30 ∼ 15:30 カルチャーコレクション委員会
15:30 ∼ 17:00 カタログ編集小委員会
6 月 20 日(火)場所:
(独)理化学研究所 生物科学研究棟小会議室(S310)
12:20 ∼ 13:00 会誌編集委員会
大会
6 月 20 日(火)
9:00 ∼ 9:30
参加登録
9:30 ∼ 9:40
開会の挨拶 大会長 辨野義己(理研 BRC・JCM)
【一般講演】
9:40 ∼ 10:25
座長 河村好章 (愛知学院大学・薬学部)
01 新属 Parabacteroides の提唱
○ 坂本光央,辨野義己
(理研 BRC・JCM)
02 Bacteroides intestinalis sp. nov., Bacteroides finegoldii sp. nov. and Bacteroides dorei sp. nov., isolated from human feces
○ Mohammad Abdul Bakir 1, Maki Kitahara 1, Mitsuo Sakamoto 1, Mitsuharu Matsumoto 2 and Yoshimi Benno 1
(1 Microbe Division/Japan Collection of Microorganisms, RIKEN BioResource Center, Wako, Saitama 351-0198, Japan; 2 Laboratory
of Dairy Science and Technology, Kyodo Milk Industry Co. Ltd., Hinode, Tokyo 190-0182, Japan)
03 Flavobacteium-Cytophaga 類縁細菌群の1属,Chitinophaga 属の再分類
○赤坂真理子,高橋麻衣,原山重明,鈴木健一朗,中川恭好
(製品評価技術基盤機構・NBRC)
─ 49 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
10:25 ∼ 10:40 休憩
10:40 ∼ 11:25 座長 能木裕一(
(独)海洋研究開発機構)
04 アラキドン酸高度産生能を有する海洋細菌の分類学的研究
○細谷 祥一 1,Vullapa Arunpairojana2,横田 明 1
(1 東大分生研・バイオリソーシス , 2TISTR, Thailand)
05 Rare genera of actinomycetes in rhizosphere soils of marine, mangrove and medicinal plants of Bangladesh
○ Ismet Ara 1 and Takuji Kudo 2
(1 Laboratory of Biological Functions, Department of Drug Discovery Sciences, Kitasato Institute for Life Sciences, Kitasato University,
5-9-1 Shirokane, Minato-ku, Tokyo 108-8641, Japan; 2 Microbe Div. / Japan Collection of Microorganisms, RIKEN BioResource
Center, 2-1 irosawa, Wako, Saitama 351-0198, Japan)
06 カフェイン分解微生物の探索
○吉田義博 1,間世田英明 2,加藤裕子 1,藤田理英子 1,後藤慶一 1,小林達彦 2
(1 三井農林(株)
・食品総合研究所,2 筑波大学大学院生命環境科学研究科)
11:25 ∼ 11:40 休憩
【特別講演】
11:40 ∼ 12:20 座長 辨野義己(理研 BRC・JCM)
下田 親(大阪市立大学大学院理学研究科)
ナショナルバイオリソースプロジェクト(酵母)の現状と将来
12:20 ∼ 13:30 昼食
13:30 ∼ 14:30 総会・授賞式
【日本微生物資源学会技術賞受賞講演】
14:30 ∼ 14:50 座長 辨野義己(理研 BRC・JCM)
余 明順(大阪大学微生物病研究所・感染症国際研究センター・病原微生物資源室)
病原微生物のハイクオリティコレクションを目指して
【日本微生物資源学会奨励賞受賞講演】
14:50 ∼ 15:10 座長 辨野義己(理研 BRC・JCM)
後藤慶一(三井農林株式会社 食品総合研究所)
好気性有胞子細菌の分類学的研究とその遺伝情報および生物資源の産業界での活用
15:10 ∼ 15:30 休憩
【シンポジウム】 「病原リソースを探る」
15:30 ∼ 18:00
コンビーナー 福島和貴(千葉大・真菌医学研究センター)
辨野義己(理研 BRC・JCM)
─ 50 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
S-1 ナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)と病原微生物保存事業
西村和子(千葉大学真菌医学研究センター)
S-2 病原微生物ポータルサイト
菅原秀明(国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センター)
S-3 腸管病原性細菌を特色とする病原微生物資源室
余 明順(大阪大学微生物病研究所・感染症国際研究センター)
S-4 病原因子の履歴を搭載したカルチャーコレクションの菌株情報発信と役割
江崎孝行(岐阜大学大学院医学研究科病原体制御分野)
S-5 病原放線菌の収集・保存・提供事業と開発事業
三上 襄 (千葉大学真菌医学研究センター)
S-6 理研バイオリソースセンター・JCM における病原リソースの系統保存事業
辨野義己 (理研 BRC・JCM)
S-7 ナショナルバイオリソースプロジェクト病原性微生物 病原性原虫保存の現状と将来
神原廣二 (長崎大学熱帯医学研究所)
18:00 ∼ 20:00 懇親会 場所:
(独)理化学研究所 広沢クラブ
6 月 21 日(水)
【一般講演】
9:30 ∼ 10:15 座長 笠井宏朗(
(株)海洋バイオテクノロジー研究所)
07 dnaJ as a new phylogenetic marker for clarification of inter-species relationships in genus Aeromonas
○ Pham Hong Nhung, Mohammad Monir Shah, Makiko Noda, Sun Xiao Song, Hirotoshi Iihara, Kiyofumi Ohkusu, Yoshiaki
Kawamura, and Takayuki Ezaki
(Department of Microbiology, Regeneration and Advanced Medical Science, Gifu University Graduate School of Medicine, 1-1
Yanagido. Gifu 501-1194, Japan)
08 radA
radA 遺伝子に基づく高熱性アーキア Vulcanisaeta 属及び関連属の系統学的多様性について
rad
吉川直人 1, 2,高品知典 2,○伊藤 隆 1
(1 理研 BRC-JCM,2 東洋大生命科学)
09 Nocardia 属放線菌の gyrB 遺伝子情報に基づく系統解析
武田健二郎,Kang Yingqian,飯田創治,矢沢勝清,三上襄
(千葉大・真菌医学研究センター)
─ 51 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
10:15 ∼ 11:15 座長 鈴木基文(理研 BRC・JCM)
10 醸造酵母の melezitose 資化能における分子生物学的アプローチ
○小倉健太郎,北條美佳,仲村佐知子,門倉利守,中里厚実
(東京農大・醸造)
11 酵母の凍結傷害に対するトレハロース、DMSO の効果について
○百瀬祐子,松本玲奈,小谷峰,山岡正和
(
(独)産総研・寄託センター)
12 内生胞子に似た細胞形態を示す Hanseniaspora 属の1種について
○今西由巳 1,二宮 真也 1,Sasitorn Jindamorakot 2,中桐 昭 1,中瀬 崇 1
(1 製品評価技術基盤機構・NBRC, 2 BIOTEC,Thailand)
13 Bacillus subtilis (natto) ファージの分類と諸性質
○永井利郎,山崎福容
(農業生物資源研究所・NIAS ジーンバンク)
11:15 ∼ 11:30 休憩
11:30 ∼ 12:00 座長 笠井文絵(国立環境研究所)
14 新種 Pleodorina starrii(緑藻・ボルボックス目)の分類と雄特異的遺伝子について
○野崎久義 1,三角修己 2,森稔幸 2,松永幸大 3,黒岩常祥 2
(1 東京大・理・生物,2 立教大・理・生命理学,3 大阪大・工・応用生物)
15 培養株に基づく Hafniomonas reticulata および H. montana の分類学的再検討
○仲田崇志 1,須田彰一郎 2,野崎久義 1
(1 東京大・理・生物,2 琉球大学・理・海洋自然科学)
12:00 ∼ 12:30 座長 鈴木健一朗(製品評価技術基盤機構・NBRC)
16 'NamesforLife' Web 配信の日本におけるローカリゼーション
Localization of 'NamesforLife' Web service in Japan
○ 志 村 純 子 1, 開 和 生 1,Abubacker Siddique Kulam Syed Mohideen 2,Donna McGarrell 2,James R. Cole 2,Catherine
Lyons 3 and George M. Garrity 2
(1(独)国立環境研究所,2 ミシガン州立大学,3 NamesforLife, LLC and Explicatrix, LLC)
17 微生物資源の経済的価値
○宮崎正浩
(跡見学園女子大)
─ 52 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
����
����������������������������
��� �
��������������
� �����������������������
�������������������������
��������E. Buchner ������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
������� Lee Hartwell � Paul Nurse ������
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
����Saccharomyces cerevisiae ������������
��������������������
Schizosaccharomyces pombe ���������������
��������������������������
��������������������������
� �����������������������
������������������ 2002 ����
������������������������
����(NBRP)�����������������
������������������������
�������������������������
����������� 24 ��������� NBRP
(Yeast)����������������������
�������������������������
���������DNA �������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
����� ��������������������
�������������������������
��S. pombe � S. cerevisiae�������������
�������������������������
�����YGRC������������
������
��������������������������
������������������������
�������������������������
�������� NBRP ��������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
������������������������
NBRP ����������������������
�������������������������
������� NBRP (Yeast)������������
�����
� ������������������������
������������������� 12,481 ���
�������������������������
�������������������������
����� AND/OR/NOT ��������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
��������������������������
� 2002 ��������������� NBRP ���
�� 2006 ��������������������
��������NBRP�Yeast�����������
�������������������������
������ HP �����������������
��������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
��������������������������
��������������������� NBRP
�Yeast����������������������
����������������
� ����NBRP (Yeast) ������������������
������
����
��
DNA clone
������
����
��
DNA clone
�������
����(2005 ��)
����
����
��
11,217
2,019
5
8,578
1,818
23,637
596
328
924
�����������NBRP/YGRC��
URL: http://yeast.lab.nig.ac.jp/nig/
�������������������
���������
��������
������ �����
��� 06-6605-2576
E-mail: [email protected]
� ������������������������
����
��������
� � � ������ ��� �
� � � ��� 06-6879-7422
E-mail: [email protected]
─ 53 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
����
������������
������������������������
�� ��
������������ ������������ ��������
� ��������������1967 ��������
���������������������1973 ��
�������������������� 1 ����
��� 1 ���������������������
�������������������������
������������
���������������������� ���
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������� 10 ���������
�������������������������
�������������������������
��������������������������
�������������������������
�������������������������
������������
�� ����������������������
���������
�� �����������������������
����������
�� ����������������������
��������������
�� �����������������������
������������������������
������������������������
������ �������������������
�������������������������
�������������������� DNA ��
�������������������������
��� DNA �������������������
�������������������������
������������
� �����������������������
���������������(ETEC)��LT,ST ��
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
����� 4�������������������
����������������������
� ���1996 �������������������
��������������EHEC��������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
��������������������������
���������� ���������������
������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
�����������Legionella pneumophila ����
������������������������
����������������������� A �
���� Coagglutination ��������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������ DNA ���30mer ����
�������������������������
�������������������������
�������������������������
��������������������������
����� 2 �������������������
������������ TDH,TRH ��������
������������� LT,ST ���������
������������������������
�������������������������
�������������������������
���� PCR ������������������
����������������������
������������ �������������
��������������������������
�������������������������
������������������������
������������������������
������
�������������� 16SrRNA ��������
�������������������������
��� Mab ���� ELISA �������������
��������PFGE � AP-PCR���������
������������
─ 54 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
������������
�������������������������������������
����
��������� �������
� �����������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������PCR ����
RAPD ��RFLP �� AFLP ������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������16S rRNA ����16S rDNA������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������
�16S rDNA �������������� 16S rDNA �
��������������������������
������������������������
��Fox et al., 1992�����������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
��� Bacillus �����������������16S
rDNA ����������������������
��������16S rDNA ������������
�������������������������
���� Bacillus �����������������
�������������������������
�������������� V1 ��� V2 ����
�� 250bp ��������������������
����������������� Bacillus ����
�����������������������
Hyper Variable��� HV��������������
�������������������������
��� Alicyclobacillus ��
Aneurinibacillus ��
Brevibacillus
��Geobacillus ��Paenibacillus ����������
������������������ HV �����
������������������������
�������������������������
������������������
� � � Alicyclobacillus � � � � � � � � � ��
Alicyclobacillus ������������20-70����
���pH 2.5-6�������������������
������������������������
�������������������������
������������������2000 �����
���������������������2000 ��
�� 3 ����������������������
����������������������� A.
acidoterrestris�������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
��Alicyclobacillus ���� HV ����������
�������������������������
�������������������������
�����A acidiphilus�A. herbarius�A. pomorum�
Alicyclobacillus genomic species 2�“A. fastidiosus”�“A.
fujiensis” � “A. fujiedaensis” � “A. kakegawaensis” � “A.
saccharis”���“A. shizuokaensis”�����������
��Alicyclobacillus ����������������
�������2006 � 4 ����17 ��1 ����� 2
�����in press ������
� Alicyclobacillus � � � � � � � � � � � � � ��
Alicyclobacillus ������������������
������������������������
�������������Alicyclobacillus �����
��� A. acidocaldarius ��������������
�������������������������
�������� DNA ����� 70%��������
���������16S rDNA ��� gyrB ������
�������������������� 16S rDNA
� gyrB � � � � � � � � � � � � � � � �
Alicyclobacillus genomic species 1 � 1 ���������
�������������������������
�������������������������
�������
� ��������������������� A.
acidoterrestris �������������������
����������������������� 200
�������������������������
�������������������������
������������������������
���
─ 55 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
������
S1� �������������������NBRP�����������
����
��������������
�NBRP���������14�����������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
����������������3000�������
��NBRP-��������������������
���������� NBRP �����������
�24 ������������� JSCC �������
�������������������������
�������������
�NBRP—��������������������
�������������������������
��������������������������
�������������������������
�������������������������
�����
��������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
��������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
������������������������2001
� 11 ����������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
��������������������������
���������
��� ����������������������
�������������������������
�������������������������
����������
���� ��� �����������������
��
��2005����
��� ��������������������
���
�2002�04���
������2005����
��� �����������������
����� ����������������2002�03
�������������������������
���������������2004����
������� ������������������
DDBJ �������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
��� ���� ����������� ��������
������������������� 7 ����
���������� 1 �������������
���
����2001 ������������������
� 20%�������� 179 ������� 300 �
������������������������
2004���������Material Transfer Agreement ��
�������������������������
�������������������������
���������������� DNA ������
�������������������������
�����DNA �����������������
����������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
���������DNA�������������
� � � � � � � � � � � � � � � � � � � orphan
collection �����������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
���
�NBRP—��������������������
���� 4 ��� 3,256 ��25�����������
�������������� 70���������
�������������������������
�������������������� BSL 3 �
��� 111 �� DNA �����Coccidioides immitis 18
���������������������
─ 56 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
S2� ������������
����
�������������DDBJ ������
�
� �����������������������
����������������������
�����������������������2004
������������������������
� 2 ��18 ������������������
�����������������������
������������������������
�����URL����� http://www.wdcm.org/byogen��
������������������������
� ������������������������
���52.7%� �����������������
�������������������������
�50.7%���������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
����
���������������������
�������������������������
�����������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
������������������������
��O-157��������������������
������������������������
�������������������������
������������������������
���������������������Web�
����������
��������������
� �����������������������
� ������������������������
������������������������
��������������������������
������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
����
������������������������
─ 57 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
S3� ���������������������
�� ��
��������������������������������
� ���������������1967 ������
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
������� ������������������
������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
���������
����� ��������������������
�������������������������
������������������������
�����������
��������������� ����������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
��������������������������
�������������������������
���������������������2002 �
������������������������
������������������������
����������������
����������������� ��������
�������������������������
�������������������������
��������������2006 � 4 ������
����� 6761 �����
����� ��������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
EHEC ����������������������
��������������������� ����
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������
���������������� HP ������
��URL: http//rceid.biken.osaka-u.ac.jp��
������������ �������������
�������������������������
�������������������������
��������������������������
�������������������������
������������������������
���������� ���������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
─ 58 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
S4� ���������������������������������
����
�������������������
�
� �����������������BSL�����
�����������������������PCR
�������������������������
������������������������
������������������������
�������������������������
�����Salmonella ����������������
�����������������
���� Enterotoxin ���� Salmonella ������
� �������� 3 ��������������
������������� BSL2 � Bacillus cereus �
�������������������������
�� Enterotoxin � 5 ��������
���� Enterotoxin
�������������������������
� 7 �������������
������� 3 ����������������
������������������������
������������������������
� ATCC � NCBI �����������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
���
�������������������������
�������������������������
� PCR ���������������������
������ BSL����������������
�������������������������
��������� Mycobacterium bovisBCG ����
�������������������������
�����������
��������������������� PCR �
� �����������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
����������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
� Salmonella enterica var. Typhi � BSL ��������
�������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������� BSL���������
��������������
������������������������
ATCC ���������������������
�������������������� BSL��
�������������������������
Salmonella enterica var. Typhi ������������
�������������������������
�������������������������
��������������������
������������������������
� �����������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
��������������������� PCR �
�������������������������
�������������������������
�������������������������
─ 59 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
S5� ���������������������
��� �
��������������
�������������� �����������
��������������� (Institute of Food
Microbiology, IFM)�����, ��� IFM �����
������. ��������, ���������
��������������. ���, ������
������, �����������. 1987 �, ��
�����������������, ������
�������, �������, ����, ����
�������������, ����������
��������. �������, ��������
�������, ����������������
���������, ��������������
������������, �����������
�����������. ������������
�����������, ������������
��������. ���������������
������������. ���, ��������
�, ������������������, ����
����, �����������������. ��
����������������, �������
������������������������
�����.
������������������������
��������NBRP��������������
��������� 2001 �������������
�������������������������
�����������������������, �
������, �����������������
��������������, ���������
�. ���������������, �������
������, ����������������.
2002 ���, ������, ������������
����������������������, �
������������������������,
NBRP �����, ����������������
��������. ��������, �������
���������������������. ���
�, 2006 �� 4 ����, ���������� 1501 �
����. ���, 994 �� Nocardia ������.
������������� ����, �������
��������������������, ���
������������������, �� 70-100
�������, ���������������, �
�����������, ������������
�. �����������������������
��, ��������� Actiomadura, Corynebacterium,
Gordonia, Mycobacterium, Nocardia, Nocardiopsis, Streptomyces,
Rhodococcus � � Tsukamurella � � � � � � � � �
Actinomyces �����������
�Nocardia �������� Nocardia �������,
2000 ������� B. Beaman ����������
�����, �����������, �������
�������������� 2003 ��������
����. ����������, ���������
�����, �������������, �����
�, �����������, �����������
� N. farcinica IFM 10152 �����, 2004 ��, ���
����, ���������������Ishikawa J,
Yamashita A, Mikami Y et al. PNAS 101: 14925-14930,
2004�, �������������.
�������� �����������������
��������������, ���������
��������������������. ��
Nocardia � Gordonia ���������������,
����� Nocardia asiatica �������� Nocardia
���� Gordonia ��������������.
������������������ �������
���������, Nocardia ����������
������������������������
���. �������, 20 ������������
� asterobactin, brasilicardin, brasilidin, brasilinolide, brasiliquinone,
transvalencin � � � � � � � � � � � � � � � . N.
farcinica IFM 10152 ����������, �����
�������������������. ����,
Nocardia ���� siderophore �����������
�������, �� siderophore ���������
������������������ Nocardia ��
�����������, �������� Nocardia
������������������������.
─ 60 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
S6� ��������������JCM �����������������
����
����������������������
������������� (BSL) 2 �������
���������� 1982 ������������
�� 25 �������������� BSL2 ����
�������������������������
���������������������� BSL2
��� 323 �������������������
�������������������������
�������������������������
���������������BSL2 �������
�������������������������
�����BSL2 �����������������
��������������������������
1998 ����������������������
���������������������BSL2 �
�������������������������
��������������������� 12,571
�����BSL2 �������� 1,414 �(11.2%)��
�������(8,220 �)����BSL2 �������
� 722 �(8.8%)������������������
���� BSL2 ������������������
�����������CCUG, CIP���������
������ BSL2 �������� 24 ������
������������ BSL2 ����5 �� 5 ��
�������������������� BSL2 ��
��� 417 �����
�����Staphylococcus aureus (22
�), Escherichia coli (15 �), Porphyromonas ginngivalis (11
�), Salmonella enterica (10 �)�����������
�������������������������
�����������������������
�������������������������
������� ������������������
�������������������������
�������������������������
���������������������� ���
�����1992 ������������� Hugh ��
�������������������������
Pseudomonas �������� 800 ���������
���� Pseudomonas sp. 204 �����������
����� ���� Pseudomonas �������16S
rDNA ������ 99%��������������
��� 53 ������������� API20NE ���
����������� ��������BSL3 ���
���������� BSL2 ������������
�����������P. aeruginosa ��������
�� Burkholderia cepacia �������� JCM ���
�������������������� �����
� 16S rDNA �������������������
���������API20NE �����������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������� ������������
�������������������������
������������������ BSL2 ����
�����������������
� ���BSL2 �������������������
�������������������������
�������
─ 61 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
S7� ������������������������
�������������
����
�����������
� 5 �����������������������
���������������������NBRP�
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
�������������������������
���������������������
� �����������������������
�������������������������
��������������������������
������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������
� ������������������������
�������������������������
������������������������
����������� NBRP �����������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������������������
� Leishmania donovani � 29 ������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������ 456 ��������
� �����������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
�������������������������
������������
─ 62 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
����
01� �� Parabacteroides ���
����������
�� BRC�JCM
� Bacteroides ��������������������������������������� Bacteroides
distasonis ��� Bacteroides merdae ��1989 �� Shah � Collins ��������� Bacteroides ����������
16S rRNA ����������������� Bacteroides �������������������������
��2005 �� Song et al.���� 2 ������������������������������ Bacteroides �
����������������������������� Bacteroides ����� Bacteroides goldsteinii ���
������������� 3 �����������������������������
� B. distasonis JCM 5825T�B. goldsteinii JCM 13446T�B. merdae JCM 9497T �������� 6 ����������
PCR ���� 16S rRNA ������������������ 6 �� 5 �� B. distasonis �������� 1 ��
B. merdae ��������3 ��� Tannerella forsythensis1)��� Bacteroides forsythus���������������
��� 3 ������������ iso-15:0 ���� anteiso-15:0 ���� T. forsythensis ������������
���T. forsythensis ���������� MK-10 ��� MK-11 ���������3 ��� MK-9 ��� MK-10 �
�����������������������������������������������20�� Bile
�������������
������� Bacteroides ������������������������ Bacteroides
���������������������T. forsythensis ������������������� Bacteroides �
MK-10 ��� MK-11�������������������� 3 ������ Bacteroides ����������
��������������
� ��������B. distasonis�B. goldsteinii ��� B. merdae ������������������������
���������Parabacteroides distasonis�Parabacteroides goldsteinii ��� Parabacteroides merdae ������
��� 2)����� P. distasonis ����
1) Sakamoto et al. (2002) Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 52, 841-849.
2) Sakamoto et al. (2006) Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 56, in press.
02� Bacteroides intestinalis sp. nov., Bacteroides finegoldii sp. nov. and Bacteroides dorei sp. nov., isolated from human feces
�Mohammad Abdul Bakir1, Maki Kitahara1, Mitsuo Sakamoto1, Mitsuharu Matsumoto2 and Yoshimi Benno1
1
Microbe Division/Japan Collection of Microorganisms, RIKEN BioResource Center, Wako, Saitama 351-0198,
Japan; 2Laboratory of Dairy Science and Technology, Kyodo Milk Industry Co. Ltd., Hinode, Tokyo 190-0182, Japan
Purpose: Six strains of anaerobic Gram-negative, non-sporeforming rods were isolated on polyamine-deficient medium during
studies of fecal microbiota. These strains showed typical characteristics of the genus Bacteroides. Polyphasic characterization and
classification of these isolates to determine their taxonomic positions are reported.
Materials and Methods: Isolation, cultivation, biochemical analysis, PCR amplification of the 16S rRNA gene, sequencing,
phylogenetic analysis & DNA-DNA relatedness were carried out following the method as described previously (1& 2).
Results and Discussions: Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequence analysis revealed that the isolated strains
belong to the genus Bacteroides. The G+C contents (41 - 44 mol%) and major cellular fatty acid compositions (anteiso-C15:0, 26 36%) also supported the affiliation of the isolated strains to the genus Bacteroides. According to phylogenetic analysis, the six
strains are distinguishable from all recognized species of the genus Bacteroides. The results demonstrated genotypic (<53%
DNA-DNA homology values) and phenotypic differentiation from the closest relatives B. uniformis, B. thetaiotaomicron and B.
vulgatus. On the basis of results, three novel species of the genus Bacteroides are proposed: Bacteroides dorei sp. nov. (JCM
13471T), Bacteroides finegoldii sp. nov., (JCM 13345T) and Bacteroides intestinalis sp. nov. (JCM 13265T).
References: 1. Kitahara, M., Sakamoto, M., Ike, M., Sakata, S. and Benno, Y. (2005). Bacteroides plebeius sp. nov. and
Bacteroides coprocola sp. nov., isolated from human faeces. Int J Syst Evol Microbiol 55, 2143 - 2147.
2. Bakir, M. A., Kitahara, M., Sakamoto, M., Matsumoto, M. & Benno, Y. (2006). Bacteroides intestinalis sp. nov., isolated
from human faeces. Int J Sys Evol Microbiol 56, 151-154.
03� Flavobacteium-Cytophaga ���������Chitinophaga �����
���������������������������
�����������NBRC
����Chitinophaga (Sangkhobol & Skerman 1981) �� phylum Bacteroidetes ���� Flavobacterium-Cytophaga ��
��� 1 ����������������������� (microcyst) ������������������
Chitinophaga pinensis 1 ������������� Flexibacter (Soriano 1945) �����������������
─ 63 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
������������ 17 �������������������� Flexibacter �� 16S rRNA �������
���������Flexibacter ������������������� 20 ������������������
����� Flexibacter flexilis ��������������� (Nakagawa et al., 2002)��� Flexibacter filiformis�
Flexibacter japonensis�Flexibacter sancti � Chitinophaga ������� Chitinophaga ��������������
������������� Flexibacter �� 3 �� Chitinophaga ����������������
�������C. pinensis NBRC 15968T�NBRC 15969�F. filiformis NBRC 15056T�F. japonensis NBRC 16041T�F. sancti
NBRC 15057T�NBRC 16033�NBRC 16034 �����DNA-DNA �����������������������
��������
� C. pinensis � 2 ��F. filiformis�F. japonensis�F. sancti � 3 ������������� MK-7������� iso 15:0�
16:1 (�5c)�3-OH iso 17:0 ������������� F. japonensis � DNA � G+C ��� 52.5 mol%�������
������ 43.7�45.7 mol%�����C. pinensis�F. filiformis�F. japonensis�F. sancti ��� DNA-DNA ����
20%�������������������������������������C. pinensis NBRC 15969 ���
��� DNA-DNA ���� 20%����� F. sancti NBRC 16034 � 17%��������������������
������������������������������� NaCl ������������������
������������������������������������������ Flexibacter �����
���������������������������������Chitinophaga �� emendation �����F.
filiformis�F. japonensis�F. sancti � Chitinophaga ���������������� Chitinophaga filiformis�
Chitinophaga japonensis�Chitinophaga sancta ������C. pinensis NBRC 15969 � F. sancti NBRC 16034 �����
� Chitinophaga ��� Chitinophaga gelatinivorax � Chitinophaga psychrovegeta �����������
������Nakagawa et al., J. Gen. Appl. Microbiol. 48, 155-165 (2002).
04� ��������������������������
���� �� 1), Vullapa Arunpairojana2), ��� � 1)
1)
��������������, 2)TISTR, Thailand
� �������������������� gliding bacteria 3 ��No. 24 ��No. 62 ��� No. 71 �������
���������
� 16S rRNA ������������������������ Bacteroidetes ���������� Saprospira ��
��������� 86%���������������������������������� Saprospira grandis
������������������������������������������������� MK-7
�����G+C ������ S. grandis NCIMB 1363T � 49.8 mol%��������� 38-39 mol%��������
��������
� ��������������������S. grandis NCIMB 1363T ������� iso-15:0�iso-17:0 3OH ���
�������������������������� 20:4 �������� 40 %�������������
������No. 24 ��No. 62 ��� No. 71 �����������������������Aureospira marina gen.
nov., sp. nov. �����������
���������������������Psychroflexus torquis (1)�Plesiocystis pacifica (2)�Krokinobacter eikastus
� Krokinobacter diaphorus (3)� 4 ������������������������� P. pacifica SIR-1T � 17.5%
��������Aureospira marina �� 40 %�������������������
����
(1) Bowman et al., Microbiology, 144:1601-1609 (1998)
(2) Iizuka et al., Int J Syst Evol Microbiol, 53:189-195. (2003)
(3) Khan et al., Int J Syst Evol Microbiol, 56:323-328. (2006)
05� Rare genera of actinomycetes in rhizosphere soils of marine, mangrove and medicinal plants of Bangladesh
�Ismet Ara1 and Takuji Kudo2
1
Laboratory of Biological Functions, Department of Drug Discovery Sciences, Kitasato Institute for Life Sciences, Kitasato
University, 5-9-1 Shirokane, Minato-ku, Tokyo 108-8641, Japan; 2Microbe Div. / Japan Collection of Microorganisms,
RIKEN BioResource Center, 2-1 Hirosawa, Wako, Saitama 351-0198, Japan
Purpose: Actinomycetes are well known as producers of novel antibiotics. We isolated about 800 strains during investigation of
distribution of rare actinomycetes in marine, mangrove and terrestrial rhizosphere soil of Bangladesh. Total distribution, diversity,
polyphasic taxonomic characterization and classification of the selected isolates to establish their taxonomic positions are
reported .
Materials and Methods: Actinomycete strains were isolated from Chokoria, Cox’s Bazar and Dhaka, Bangladesh using the
standard dilution plate method and humic acid-vitamin agar. Classification based on 16S rDNA sequences, DNA relatedness at
the species level and characteristic patterns of signature nucleotides at the genus and family level were conducted for
distinguishing and differentiating members of actinomycetes. Genomic DNA extraction, PCR-mediated amplification of the
─ 64 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
16S rRNA genes and sequencing of the PCR products were carried out as described by Nakajima et al. (1). DNA-DNA
relatedness was measured fluorometrically using the microplate hybridization method devised by Ezaki et al. (2).
Results and Discussion: Actinomycete populations (colony forming units/g, soil samples) ranged from 1x103 to 157x103 in
rhizosphere soils of marine and mangrove and 22x103 to 168x103 in rhizosphere soils of different medicinal plants. The highest
number of isolates was obtained from Chokoria (55%) mangrove source and from the rhizosphere soil of Abroma augasta (15%).
Micromonospora (~38%) was observed as major genus in the studied samples. Among the 800 isolates, total 34 isolates were
selected and the 16S rDNA sequence analysis showed that these strains belonged to Micromonosporaceae, Streptosporangiaceae
and Thermomonosporaceae family. A total of 20 new species and 3 new genera have been established from 34 selected strains.
This study showed successful isolation of diverse and novel actinomycetes. Results of this study may provide valuable
information and offer an excellent source for the discovery of novel bioactive compounds.
References:
(1) Nakajima, Y., Kitpreechavanich, V., Suzuki, K. & Kudo, T. (1999). Microbispora corallina sp. nov., a new species of the
genus Microbispora isolated from Thai soil. Int J Syst Bacteriol 49, 1761-1767.
(2) Ezaki, T., Hashimoto, Y. & Yabuuchi, E. (1989). Fluorometric deoxyribonucleic acid- deoxyribonucleic acid hybridization
in microdilution wells as an alternative to membrane filter hybridization in which radioisotopes are used to determine genetic
relatedness among bacterial strains. Int J Sys Bacteriol 39, 224-229.
06� ��������������
����� �������� ������� �������� ������� ������� ���
��
�������
����������������������������
��� �������������������������������������������������
����������������������������������������������������
����������������������������������������������������
����������������������������������������������������
����������������������������������������������������
����������������������������������������������������
����������������������������������������������������
����������������������������������������������������
�����
��������
�����������������A)������������������ 33 ���������������
�������������������������������������������������(B)��
�������250ppm�������������1 ����������������������������
����(C)��������������� 92 ��������������������
���������������(1)�������28�� 48 ���������������������� HPLC
������������5%����������������������(2)���������������
���������������������� OD600=1.0 ��������������������2 ����
� 6 ��������������� HPLC ������
��������MicroSeq 16S Top500 ����MicroSeq D2 ������ MicroSeq �������Applied Biosystems�
������������������ MEGA 3.1�Kumar����������
�������(A)33 ������ 359 �����������������������87 �����������
��1 �������������������(B)3 ������ 54 ������������������16 �
����������(C)92 ���������������������18 �����������������
�������������4 ����������������������Proteobacteria��� Pseudomonas spp.�
���������������Methylobacterium�Enterobacter �����������Arthrobacter�Bacillus �
Staphylococcus ����������������������������������������������
����������������������������
07� dnaJ as a new phylogenetic marker for clarification of inter-species relationships in genus Aeromonas
�Pham Hong Nhung, Mohammad Monir Shah, Makiko Noda, Sun Xiao Song, Hirotoshi Iihara, Kiyofumi Ohkusu,
Yoshiaki Kawamura, and Takayuki Ezaki
Department of Microbiology, Regeneration and Advanced Medical Science, Gifu University Graduate School of Medicine,
1-1 Yanagido. Gifu 501-1194, Japan
Introduction: The discordance between 16S rDNA sequence and DNA-DNA hybridization studies engendered controversy in
the taxonomy of the genus Aeromonas. Many approaches were reported to attempt at clarifying the phylogenetic relationships
among Aeromonas species but species delineation remains difficult. We targeted dnaJ gene to improve the reliability of
─ 65 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
allocations of species in the genus Aeromonas
Methods: Approximately 891 bp portion of dnaJ gene sequences of the 27 Aeromonas species and subspecies were determined.
To evaluate dnaJ as a phylogenetic marker, the topology of trees obtained from dnaJ gene, 16S rDNA and other housekeeping
gene sequences i.e. rpoD, gyrB were compared and analyzed. Phylogenetic relations were constructed by neighbor-joining
method using CLUSTAL W software.
Results and Conclusion: Phylogenetic tree based on dnaJ sequences showed considerable divergence between all Aeromonas
species as that was represented in gyrB and rpoD trees. At the species level, gyrB and rpoD behaved differently depending on
species. Our dnaJ sequences supported rpoD sequences in clarification of the inter-species relationships. Pairwise sequence
comparison revealed dnaJ resolution power (89.2%) much more divergent than 16S rDNA (98.8%) but comparable to gyrB
(92.2%), and rpoD (90.6%). We concluded that dnaJ gene could be used as an alternative marker for unraveling phylogenetic
relationships among Aeromonas species.
References:
1. Int. J. Syst .Evol. Microbiol. 54, 1511-1519.
2. Int. J. Syst. Bacteriol. 42, 412-421.
08� rad A �������������� Vulcanisaeta �������������������
���� ��������� ������� � ���
���
�� BRC-JCM���� ��������
� ����������������������������� Vulcanisaeta distributa �� V. souniana �����
������ 16S rDNA ������������������������
�1�V. distributa ���� 16S rDNA �
����������������������������������������������������
���������������2�V. distributa �������������������������������
�� V. souniana ���������������������������������������������
����������������������������������������������������
����������������������������������������������������
Vulcanisaeta ���������� rad A ������������ 400bp�������������������
� ���� V. distributa � V. souniana �� 16S rDNA ���� rad A ������������������V. distributa
����������������������������������������������������
�� Vulcanisaeta �� Caldivirga ��Thermocladium ��������������16S rDNA ����������
������
09� Nocardia ����� gyrB �������������
������, KANG YINGQIAN, ����, ����, ���
��������������
��������������������� 16S rDNA ����� (16S rDNA) ���������������
����������������������������������������������Nocardia ��
���������������16S rDNA �����������������������
1995 ����������������� 16S rDNA �������������� DNA �����������
������ (gyrB) ������������������� 1��������� DNA-DNA ���������
��� gyrB ��������������������� 2�
�������� gyrB ������ Nocardia �������������������
�������������� gyrB ���� Universal primer ��� Nocardia � gyrB ��� (� 1200bp) �����
���� primer ������������������� Nocardia ��� (58 �) ������ gyrB ������
������ (ABI PRISM 3130) ���������������� GENETYX �������ClustalW �����
��������������
�������Nocardia ��������� gyrB ����� 82.417-99.917�� 16S rDNA ������������
������ 16S rDNA ��������� (complex) ���������������������������
����gyrB � 16S rDNA ������������������������������������� complex
������ 1 ����������������������������� gyrB ��������������
����������� primer ��������������������� gyrB ��� bp ����������
����������������������
������
1. S. Yamamoto et al., Appl. Environ. Microbiol. 61 :1104-1109 (1995)
2. S. Yamamoto et al., Int. J. Syst. Bacteriol. 49 :87-95 (1999)
─ 66 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
10� ����� melezitose ������������������
���������������������������
�������
� �������������������������������������� Saccharomyces cerevisiae ��
����������������������������������������������������
���������������������������������������� melezitose �������
����� 1 ���������S. cerevisiae �������(������������������)� melezitose
����������������������������������������������������
���������������������������������������������� melezitose �
���melezitose ������������������������ MAL ��������melezitose �����
��������������
� ����(9 �)�S. cerevisiae IFO 10217T����������(2 �)������(2 �)��������(2 �)��
���(2 �)�� 18 ����������melezitose ����������������melezitose ����� melezitose
����������������������������������������������������
���������� melezitose �������������������������������������
����������������� MAL transporter ���������������MAL ����������
�������������������������������PFGE-�������������������
����� MAL transporter genes �����������II ������ MAL transporter genes ����������
melezitose ���������������II ������� melezitose ������������������
melezitose ����� MAL 11 ����� VII ����� XV �������������������������
�������������� MAL 11 ����������������������������������
�� melezitose ���������������������� 96������
� ������������� melezitose ��������������� MAL transporter genes ��������
��� MAL 11 ������ transporter ���������������������
11� ������������������DMSO ��������
��������������������
��������������
����������������������������������������������������
�������������������������������������� Saccharomyces cerevisiae (S288C)
����������������������������������������������������
�������� DMSO ������������ total RNA ������������������������
������
������������������(A660=1.0)��������������������/ min �-80�����
������������� Vybrant Apoptosis Assay #4 YO-PRO-1 kits ���������������������
��������������������� total RNA ���������������������������
�������DMSO ������������������������������������� DMSO �
����������������DMSO �������������� RNA ����������������
����������� DMSO ��������������������������������������
���������������������������������� DMSO �������� DMSO ���
����������������������������������������������������
������������������������������
12� �������������� Hanseniaspora ���������
����� ������� ���Sasitorn Jindamorakot ������ ������� ���
��
���������� ���������� �������
� Hanseniaspora ����� �� ��������������������������������������
����������������������������������������������������
� 2003 ���������������������
��� Hanseniaspora ��������(Y03-106-17)�����
�����YM ��������������������� endospore���������������endospore
����� Trichosporon, Candida, Cryptococcus, Oosporidium, Cystofilobasidium, Leucosporidium �����������
����������������������������������
������� endospore ����� YM ������������� Corn meal agar �������������
��������������������������������� endospore ��������������
����������������������������������������������������
���������������� Malachite green �����������������������������
─ 67 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
endospore ����������������������� endospore ��������������������
�����������������������������������������������������
����������������������������������Hanseniaspora �������26S rDNA
D1/D2 �����������������������������Y03-106-17 ���������������
������������������������ Haneseniaspora guilliermondii NBRC 100529 (=CBS 8772)���
���������������� ST 398 ��������� 2 ���������������endospore ���
���������� 3 �����������������������������������������
���� 3 ���� Hanseniaspora ��������26S rDNA ����������������� 3 ��
Hanseniaspora �������������1 �������������������� DNA ���������
��Hanseniaspora ������� 41.9%������������������������ 3 ���������
Hanseniaspora �������������������endospore ���������������������
13� Bacillus subtilis (natto)������������
�����������
����������NIAS �������
����NIAS �������������������� Bacillus subtilis (natto)����� 20 ���������
������ �����(� 10 ���)����������������������������������
����������������������������������������������������
����������������������������������
������������ MAFF ��� 20 ���������� B. subtilis (natto) HM ����������� DNA
����������������������������������������������������
�������������������� 10 ������������������������������
������������������������������������������
�������20 ����������������2 �����������(���� JNDMP ��������
�������� ONPA �����������)�ONPA ��������������������������
�������������������������ONPA ������������������������
���������������JNDMP ����������3 �����������������������
�����������
� ���JNDMP � ONPA ������������������JNDMP � non-contractile �����������
��������� 40 kb ��������ONPA � contractile �������������� 90 kb �����ONPA
�������� 10���������������������50%��������������������
���������� 100 ���������� ONPA � 55 ��JNDMP � 35 ������
� ��������������1960 ������������ 2 ��������(������)�������
����������������������������������������������������
����������������������������������������������������
�������������������������� 3 ������������� 3 �� JNDMP �� ONPA
���� DNA ���������������������JNDMP ������� 2 ���ONPA � 1 �����
������(����� 3 ��������������� 2 ��������������������)���
� 2 ��������������� DNA ����������������� JNDMP � ONPA ��������
�����������������������������2 ���������������
14� �� Pleodorina starrii ����������������������������
����� ������� ������ ������� ������� ���
���
�������������������������������������
� �������� Pleodorina ��������������������������������������
���������������������������������(Coleman 1999, PNAS; Nozaki et al. 2000,
MPE)�������������������������������������������
� �����������Pleodorina ��������� Pleodorina starrii �������������������
����������32�64 ���������������� 1/3 ���������������������
����������������������������������������������������
���� P. californica � P. japonica ����������P. indica ���������������������
�������� 6021 ��������������������P. starrii � P. indica ��������P.
californica � P. japonica ����������P. starrii� ����������������������� RNA �
������������ RT-PCR� ������������ Chlamydomonas ��������������
Mid �����������(Ferris & Goodenough 1997, Genetics) ���������������� Chlamydomonas
� Mid ��������� 150 ����������3' ����������� RWP-RK �����������
─ 68 ─
Microbiol. Cult. Coll. June 2006
Vol. 22, No. 1
������������� PCR ������������������������������������
��������������������������Mid ��� Chlamydomonas ��������������
����������������������������������������������������
��������������� P. starrii ��������������������
15� ��������Hafniomonas reticulata ��� H. montana ���������
����� �������� ������� ���
���
��������������������������
� Hafniomonas ���� 4 ����������������������������������������
����������������� 10 ������������������������� 1925 �����
������ H. reticulata ��������� H. montana � 2 �����������������������
����������H. reticulata ���������������������������� H. monatana ��
����������� 2 �������������������������������������� H.
reticulata � H. monatana ������������������������� 6 ���� NIES-257�656 ��
��� psaB ������ 18S rRNA ������������������������������������
���������������H. reticulata
���������� 4 �� Hafniomonas �������������
��������������������������Korshikov 1925�������� 4 ����� H. reticulata
������������������������������������������Ettl & Moestrup 1980 �
���������� 4 �� H. reticulata �����Ettl & Moestrup (1980) ���� H. reticulata ��������
����������������������������������������������
H. monatana �������� NIES-257 �� NIES-656 �������������������������
�����������������������������������������2 ����������
����NIES-656 �����������������������Geitler 1925��NIES-257 ���������
����������������������������������������
Ettl, H. & Moestrup, Ø. 1980. Pl. Syst. Evol. 135: 177-210.
Korshikov, A. A. 1925. Russ. Arch. Protist. 4: 153-97.
Geitler, L. 1925. Arch. Protistenkd. 52: 356-70.
16� 'NamesforLife' Web �������������������
Localization of 'NamesforLife' Web service in Japan
����� ����� �� ���Abubacker Siddique Kulam Syed Mohideen2), Donna McGarrell2), James R. Cole2), Catherine
Lyons3) and George M. Garrity2)
1)
�����������2)���������3)NamesforLife, LLC and Explicatrix, LLC
����� NamesforLife(N4L) (�� 1)��������������������������DOI®���� 2-5���
�������������������������������������������������
Taxonomic Outline(�� 6)���� Prokayotes ��������������������������������
����������������������������������Taxonomic Outline � N4L �������
�������������������������� N4L � Web �����������������
�������� Taxonomic Outline of the Prokaryotes (version 6.0) (�� 6) � SGML �� N4L � 24,176 �������
��������� XML ������������������������������ JSP(Java Server Pages)���
��������� Web ������������� XML �������������������������
�������������������������������������������������(���
����N4L �:Tomcat 5.5.11, Java 1.4, Servlet 2.4, JSP 2.0, JSTL 1.1, PostgreSQL, Linux 2.6.9-5.ELsmp, SunOS 5.6, ���
�:Apache 2.x, Ruby 1.8.x, Rails 1.0, PostgreSQL 8.1, FreeBSD 6.0R)�
�������� ��������������������������������������������
� � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � ��� � � � � � � � � � � � � � � � � � � URL�
�������������� N4L ������������������ Web ���
http://158.210.250.115/n4l4n/�
��������������������������������������� Taxonomy Outline �����
��������������������������������N4L ���������� DOI ������
����������������������������������������������������
����������������DOI ����� ISO ���������������������������
�������������������������� N4L �����������������
������
���Garrity, G.M. and C. Lyons, 2005, Systems and Methods for Presolving Ambiguity Between Names and � � � �
Entities. USPTO. USA Application # PCT/US 2005/001688
���Paskin, N. 2002. Digital Object Identifiers, vol. IOS Press.
─ 69 ─
日本微生物資源学会第 13 回大会
���Paskin, N. 2004. Presented at the 19th International CODATA Conference, Berlin, November 10, 2004.
���Paskin, N. (ed.). 2003. DRM Technologies: Identification and Metadata, vol. Springer-Verlag, Heidelberg.
���Paskin, N. 2005 February 2005, posting date. The DOI® Handbook Version 4.2.0. International DOI Foundation.
DOI:10.1000/182 [Online.]
���Garrity, G.M., J. Leventhal and T.G. Lilburn, 2005, posting date. Taxonomic Outline of the Procaryotes, Bergey’s
Manual of Systematic Bacteriology, Second Edition, Release 6.0. May. 2005. Springer [Online]
�� URL: http://dx.doi.org/10.1601/tx.0
http://www.doi.org/
http://java.sun.com/
http://tomcat.apache.org/
http://158.210.250.115/n4l4n/
17� ������������
Economic value of microbial resources
��� ���
����������������������������������������
����������������������������������������������������
��������������������������������������������� ���������
�����CBD���������������������������������������������
������������
���������������������������������������������������
�����������������������������������
����������������������������������������������������
���������������������������������������������������
��������������
���������������������������������������������������
��������������������������������������������
������������������������������������������������� US$2�
60 ���������������������������������������������������
����������������������������
��������CBD �����������������������������������������
������������������������������������������
─ 70 ─
Fly UP