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イノリパ (SSO) 法 に つ い て

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イノリパ (SSO) 法 に つ い て
INNO-LiPA (SSO)
参加施設は昨年以上に少なく、参加4施設中1施設は他のキットの補助でした。
今年から、方法別判定では、日本人に多く見られるアリルを優先するのではなく、学会の表記法に従い、
判定されたすべてのアリルを対象とすることとしました。
そのため、イノリパでは第2区域のambiguityの小さい数を探すのに、労力を必要としました。第2区域の
Ambiguityの2桁が異なっていても減点にはなりませんが、より小さい数を探し出せなかった施設の判定結果
には、今後の参考のために各アリルの下または後に青字で必要なAmbiguityを示しました。
また、方法別の結果報告の原則として第一区域のambiguityがあるものは、すべて記載する必要があり
ましたが、表記が正しくないアリルについては赤字で示しました。
INN-LiPA ( HLA-ClassⅠ)
H2601
HLA-A
26D12 A*26:01/02/10/+
26D19 A*26:01/02/10/+
26D24 A*26:01/02/10/+
H2602
A*31:01/11/13/+
/09/
A*31:01/13/14/+
/09/11/+
A*31:01/09/11/+
HLA-A
26D12 A*02:01/07/09/+
26D19 A*02:01/07/09/+
A*24:02/11/20/+
/03/08/+
A*24:02/11/20/+
/03/08/+
26D22
26D24 A*02:01/07/09/+
HLA-B
B*40:02/56/57/+ B*46:01/02/15/+
/11/29/
/12/
B*40:02/56/57/+ B*46:01/02/15/+
/11/29/
/12/
B*40:02/11/29/+ B*46:01/02/12/+
HLA-B
B*46:01/02/15/+ B*59:01/04
B*46:01/02/15/+ B*59:01/04
B*46:01/02/15/+ B*59:01/04
A*24:02/03/08/+
B*46:01/02/15/+
B*59:01/04
INN-LiPA ( HLA-ClassⅠ)
H2603
26D12
26D19
26D24
H2604
26D12
26D19
26D24
HLA-A
HLA-B
A*03:01/04/05/+ A*24:02/05/11/+
/02/
/03/
A*03:01/02/04/+ A*24:02/11/20/+
/03/05/
B*40:01/22/54/+
/14/
B*40:01/22/54/+
/14/
B*44:02/19/23/+
/03/07/
B*44:02/19/23/+
/03/07/
A*03:01/02/04/+ A*24:02/03/05/+
B*40:01/14/22/+
B*44:02/03/07/+
HLA-A
A*24:02/11/20/+ A*26:01/02/04/+
/03/10/
A*24:02/11/20/+ A*26:01/02/10/+
/04/
/03/10/
A*24:02/03/10/+ A*26:01/02/04/+
HLA-B
B*15:01/28/38/+
/24/
B*15:01/60/82/+
/24/28/
B*15:01/24/28/+
B*52:01/05/07/+
B*52:01/05/07/+
B*52:01/05/07/+
INN-LiPA (HLA-ClassⅠ)
26D12
HLA-C
H2601 C*01:02/03/05/+
H2602 C*01:02/03/05/+
C*03:04/06/09/+
C*03/15
ー
C*01/14
H2603 C*05:01/03/04/+
C*03:04/06/09/+
C*05/08
C*03:02/04/05/+
H2604 C*12:02/11/22/+
C*03/12
C*03:03/12/20/+
INN-LiPA ( HLA-ClassⅡ)
H2601
HLA-DRB1
26D12-2
DRB1*08:03/10/23/+
DRB1*09:01/02/05/+
26D19-2
DRB1*08:03/10/23/+
DRB1*09:01/02/05/+
26D24-2
DRB1*08:03/10/23/+
DRB1*09:01/02/05/+
H2602
26D12-2
HLA-DRB1
DRB1*04:05/10/11/+
DRB1*09:01/02/05/+
DRB1*04:03/05/06/+
DRB1*04/09 /04/
26D19-2
DRB1*04:05/10/29/+
DRB1*09:01/02/05/+
26D24-2
DRB1*04:03/05/06/+
DRB1*09:01/02/04/+
DRB1*04:03/05/06/+
DRB1*04/09 /04/
DRB1*04/09
INN-LiPA ( HLA-ClassⅡ)
H2603
26D12-2
HLA-DRB1
DRB1*13:01/02/16/+
DRB1*15:01/02/03/+
DRB1*13/15
26D19-2
DRB1*13:01/02/16/+
DRB1*15:01/02/03/+
26D24-2
DRB1*13:01/02/09/+
DRB1*15:01/02/03/+
H2604
DRB1*13/15
DRB1*13/15
HLA-DRB1
26D12-2
DRB1*14:03/12/98
DRB1*15:01/02/03/+
26D19-2
DRB1*14:03/12/98
DRB1*15:01/02/03/+
26D24-2
DRB1*14:03/12/98/+
DRB1*15:01/02/03/+
INN-LiPA ( HLA-ClassⅡ)
26D12
HLA-DQB1
H2601
DQB1*06:01/43
DQB1*03:03/15/31/+
H2602
DQB1*04:01/06/07/+
/05/
DQB1*03:03/12/15/+
H2603
DQB1*06:03/41/44
/43/
DQB1*06:01/03/41/+
H2604
DQB1*03:01/13/19/+
/10/
DQB1*06:01/35/43
INNO-LiPA (HLA-A)
H2601 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44
D12 1 1 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 1 8 8 1 8 1 1 1 1 1 8 8 1 8 1 8 1 1 1 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 8 8 1
D19
1
1
6
1
6
1
1
6
6
1
1
1
1
6
6
1
6 1 1
1
1
1
6
6
1
6
1
6
1
1
1
4
1
6
1
1
6
6
1
1
1
6
6
1
1
1
8
1
8
1
1
8
8
1
1
1
1
8
8
1
8 1 1
1
1
1
8
8
1
8
1
8
1
1
1
6
1
8
1
1
8
8
1
1
1
8
8
1
D22
D24
H2602
D12
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44
1 8 1 8 1 8 8 1 1 1 8 1 8 8 1 8 8 1 1 1 8 8 1 1 1 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1 8 1 8 8 1 1 8 1
D19
1 6 1 6 1 6 6 1 1 1 6 1 4 6 1 6 6 1 1 1 6 6 1 1 1 6 1 6 1 6 6 1 1 1 1 1 8 1 6 4 1 1 6 1
D22
D24
H2603
D12
1 8 1 8 1 6 8 1 1 1 8 1 6 8 1 8 8 1 1 1 8 8 1 1 1 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1 8 1 8 6 1 1 8 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44
1 8
1
8
1 1
8
8
1 1
1
8
1 8
1
8
8 1 1 1
1
8
1 1
1
8
1 8
8
1
8 1
1
1
1 1
8
1
8 8
1
1
8 1
1 6
1
6
1 1
6
6
1 1
1
6
1 6
1
6
6 1 1 1
1
8
1 1
1
6
1 6
4
1
6 1
1
1
1 1
6
1
6 4
1
1
4 1
1 8
1
8
1 1
8
8
1 1
1
8
1 8
1
8
8 1 1 1
1
8
1 1
1
8
1 8
6
1
8 1
1
1
1 1
8
1
8 8
1
1
6 1
H2604
D12
1
1
2
1
3
8
4
8
5
1
6
1
7
8
8
8
9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44
8 1 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 1 8 8 1 1 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 1 1 8 8 8 1 8 8 1
D19
1
1
6
6
1
1
6
6
6
1
1
8 8
D19
D22
D24
1
1
1
1
6
6
6
1 1 1
1
1
6
4
1
1 1
8
8 1
1
6
1
6
1
1
6 4 1
1
1
1 8
1
8 1
1
8 6 1
1 1
1
1
6
6
4
1
6
4
1
1 1
8
8 8
1
8 6
1
D22
D24
1 1 8
8 8 1
1 1 1
8 8 8 1 1 1
H2601
INNO-LiPA (HLA-B)
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67
D12 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 8 1 8 1 1 8 1 1 8 1 8 1 1 1 1 8 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 8 1 1 1 1 8 8 1 1 1 8 1 8 1 8 8 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 1
D19 1 1 6 1 1 1 6 1 1 6 1 6 1 6 1 1 6 1 1 4 1 6 1 1 1 1 6 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 4 6 1 1 1 1 6 4 1 1 1 6 1 6 1 6 6 6 1 6 1 1 8 8 1 1 1 1
D22
D24 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 8 1 8 1 1 8 1 1 8 1 8 1 1 1 1 8 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 6 8 1 1 1 1 8 6 1 1 1 8 1 8 1 8 8 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 1
H2602
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67
D12 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 1 1 8 1 8 8 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 1 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 8 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1
D19 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6 6 1 1 4 1 6 4 1 1 4 1 1 6 1 1 1 6 1 1 6 1 1 1 6 6 6 1 1 1 1 6 1 1 6 1 6 4 1 1 1 1 6 1 1 6 4 4 1 6 1 6 6 1 1 1 1 2
D22 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 1 1 8 1 8 8 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 1 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 8 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1
D24 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 1 1 6 1 8 8 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 1 8 6 1 1 1 1 8 1 1 8 8 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1
H2603
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67
D12 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 8 1 8 1 8 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 8 8 1 8 1 8 8 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1
D19 1 1 1 6 1 1 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 6 1 4 1 4 1 6 1 1 1 1 1 6 1 1 1 1 6 1 1 1 4 6 1 6 1 6 6 1 6 1 1 1 6 6 6 1 1 2
D22
D24 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 8 1 6 1 6 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 6 8 1 8 1 8 8 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1
H2604
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67
D12 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 1 1 8 8 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 8 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 8 1 1 1 8 1 1 1 8 1 8 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1
D19 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 1 1 6 4 1 1 6 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 6 6 1 1 1 6 6 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 6 4 1 1 1 6 1 1 1 6 1 6 1 6 1 1 8 1 1 1 8 2
D22
D24 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 1 1 8 8 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 8 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 6 1 1 1 8 1 1 1 8 1 8 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1
INNO-LiPA (HLA-DRB1)
: False positive
H2601
D12
1
1
2
1
3
1
4
1
5
1
6
1
7
1
8
8
9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37
1 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 1 8 8 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
D19
1
1
1
1
1
1
1
4
1
2
1
1
6
6
6
1
1
1
1
1
6
8
1
1
1
1
1
1
1
2
1
1
1
1
1
1
1
D24
1
1
1
1
1
1
1
8
1
1
1
1
8
8
8
1
1
1
1
1
6
8
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
D12
1
1
2
1
3
1
4
1
5
1
6
1
7
1
8
1
9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37
1 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8
D19
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
2
1
6
6
6
1
1
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6
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1
1
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1
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1
1
2
1
1
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1
8
8
D24
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1
1
1
1
1
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8
8
8
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1
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1
8
1
1
1
1
1
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1
1
1
1
1
1
1
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8
8
H2602
H2603
D12
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1
2
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3
1
4
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5
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6
1
7
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8
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9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37
8 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 1 1 8 1 1 8 1 1 8 8 8 1 1 1 1 1 1
D19
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1
1
1
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6
2
6
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1
1
1
6
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1
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1
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2
8
2
1
6
2
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6
8
6
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1
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1
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D24
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1
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6
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8
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8
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1
1
8
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1
8
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1
8
8
8
1
1
1
1
1
1
H2604
D12
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1
2
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3
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4
1
5
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6
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7
8
8
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9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37
8 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 8 8 1 1 8 1 8 1
D19
1
1
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1
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8
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6
2
6
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1
1
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6
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1
6
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8
2
1
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6
6
1
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6
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6
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D24
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6
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8
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8
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1
1
1
8
1
1
1
8
8
1
1
8
1
8
1
結果
*日本人に多いアリルを優先するのであれば、どの施設も正解ですが、方法別では判定されたすべての
アリルから選ぶのが原則ですので、正解とは言えない結果が多く見られました。昨年統一した、方法別の
結果報告の原則が徹底されていなかったようですので、今回は誤判定とはいたしません。
*26D19の施設はクラス1では弱いバンドが多く見られ、クラスⅡでは弱いfalse positiveが多く見られました。
発色ではなく増幅に問題があるかも知れません。
*C ローカスについては原則では多くが抗原型のambiguityとなるはずですので、本来は不正解となります。
*全体に、昨年お知らせした方法別判定の原則が守られておらず、日本人に多いアリルを優先して記載され
たようです。
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