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イノリパ (SSO) 法 に つ い て
INNO-LiPA (SSO) 参加施設は昨年以上に少なく、参加4施設中1施設は他のキットの補助でした。 今年から、方法別判定では、日本人に多く見られるアリルを優先するのではなく、学会の表記法に従い、 判定されたすべてのアリルを対象とすることとしました。 そのため、イノリパでは第2区域のambiguityの小さい数を探すのに、労力を必要としました。第2区域の Ambiguityの2桁が異なっていても減点にはなりませんが、より小さい数を探し出せなかった施設の判定結果 には、今後の参考のために各アリルの下または後に青字で必要なAmbiguityを示しました。 また、方法別の結果報告の原則として第一区域のambiguityがあるものは、すべて記載する必要があり ましたが、表記が正しくないアリルについては赤字で示しました。 INN-LiPA ( HLA-ClassⅠ) H2601 HLA-A 26D12 A*26:01/02/10/+ 26D19 A*26:01/02/10/+ 26D24 A*26:01/02/10/+ H2602 A*31:01/11/13/+ /09/ A*31:01/13/14/+ /09/11/+ A*31:01/09/11/+ HLA-A 26D12 A*02:01/07/09/+ 26D19 A*02:01/07/09/+ A*24:02/11/20/+ /03/08/+ A*24:02/11/20/+ /03/08/+ 26D22 26D24 A*02:01/07/09/+ HLA-B B*40:02/56/57/+ B*46:01/02/15/+ /11/29/ /12/ B*40:02/56/57/+ B*46:01/02/15/+ /11/29/ /12/ B*40:02/11/29/+ B*46:01/02/12/+ HLA-B B*46:01/02/15/+ B*59:01/04 B*46:01/02/15/+ B*59:01/04 B*46:01/02/15/+ B*59:01/04 A*24:02/03/08/+ B*46:01/02/15/+ B*59:01/04 INN-LiPA ( HLA-ClassⅠ) H2603 26D12 26D19 26D24 H2604 26D12 26D19 26D24 HLA-A HLA-B A*03:01/04/05/+ A*24:02/05/11/+ /02/ /03/ A*03:01/02/04/+ A*24:02/11/20/+ /03/05/ B*40:01/22/54/+ /14/ B*40:01/22/54/+ /14/ B*44:02/19/23/+ /03/07/ B*44:02/19/23/+ /03/07/ A*03:01/02/04/+ A*24:02/03/05/+ B*40:01/14/22/+ B*44:02/03/07/+ HLA-A A*24:02/11/20/+ A*26:01/02/04/+ /03/10/ A*24:02/11/20/+ A*26:01/02/10/+ /04/ /03/10/ A*24:02/03/10/+ A*26:01/02/04/+ HLA-B B*15:01/28/38/+ /24/ B*15:01/60/82/+ /24/28/ B*15:01/24/28/+ B*52:01/05/07/+ B*52:01/05/07/+ B*52:01/05/07/+ INN-LiPA (HLA-ClassⅠ) 26D12 HLA-C H2601 C*01:02/03/05/+ H2602 C*01:02/03/05/+ C*03:04/06/09/+ C*03/15 ー C*01/14 H2603 C*05:01/03/04/+ C*03:04/06/09/+ C*05/08 C*03:02/04/05/+ H2604 C*12:02/11/22/+ C*03/12 C*03:03/12/20/+ INN-LiPA ( HLA-ClassⅡ) H2601 HLA-DRB1 26D12-2 DRB1*08:03/10/23/+ DRB1*09:01/02/05/+ 26D19-2 DRB1*08:03/10/23/+ DRB1*09:01/02/05/+ 26D24-2 DRB1*08:03/10/23/+ DRB1*09:01/02/05/+ H2602 26D12-2 HLA-DRB1 DRB1*04:05/10/11/+ DRB1*09:01/02/05/+ DRB1*04:03/05/06/+ DRB1*04/09 /04/ 26D19-2 DRB1*04:05/10/29/+ DRB1*09:01/02/05/+ 26D24-2 DRB1*04:03/05/06/+ DRB1*09:01/02/04/+ DRB1*04:03/05/06/+ DRB1*04/09 /04/ DRB1*04/09 INN-LiPA ( HLA-ClassⅡ) H2603 26D12-2 HLA-DRB1 DRB1*13:01/02/16/+ DRB1*15:01/02/03/+ DRB1*13/15 26D19-2 DRB1*13:01/02/16/+ DRB1*15:01/02/03/+ 26D24-2 DRB1*13:01/02/09/+ DRB1*15:01/02/03/+ H2604 DRB1*13/15 DRB1*13/15 HLA-DRB1 26D12-2 DRB1*14:03/12/98 DRB1*15:01/02/03/+ 26D19-2 DRB1*14:03/12/98 DRB1*15:01/02/03/+ 26D24-2 DRB1*14:03/12/98/+ DRB1*15:01/02/03/+ INN-LiPA ( HLA-ClassⅡ) 26D12 HLA-DQB1 H2601 DQB1*06:01/43 DQB1*03:03/15/31/+ H2602 DQB1*04:01/06/07/+ /05/ DQB1*03:03/12/15/+ H2603 DQB1*06:03/41/44 /43/ DQB1*06:01/03/41/+ H2604 DQB1*03:01/13/19/+ /10/ DQB1*06:01/35/43 INNO-LiPA (HLA-A) H2601 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 D12 1 1 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 1 8 8 1 8 1 1 1 1 1 8 8 1 8 1 8 1 1 1 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 8 8 1 D19 1 1 6 1 6 1 1 6 6 1 1 1 1 6 6 1 6 1 1 1 1 1 6 6 1 6 1 6 1 1 1 4 1 6 1 1 6 6 1 1 1 6 6 1 1 1 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 1 8 8 1 8 1 1 1 1 1 8 8 1 8 1 8 1 1 1 6 1 8 1 1 8 8 1 1 1 8 8 1 D22 D24 H2602 D12 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 1 8 1 8 1 8 8 1 1 1 8 1 8 8 1 8 8 1 1 1 8 8 1 1 1 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1 8 1 8 8 1 1 8 1 D19 1 6 1 6 1 6 6 1 1 1 6 1 4 6 1 6 6 1 1 1 6 6 1 1 1 6 1 6 1 6 6 1 1 1 1 1 8 1 6 4 1 1 6 1 D22 D24 H2603 D12 1 8 1 8 1 6 8 1 1 1 8 1 6 8 1 8 8 1 1 1 8 8 1 1 1 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1 8 1 8 6 1 1 8 1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 1 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 8 1 1 1 8 1 8 8 1 8 1 1 1 1 1 8 1 8 8 1 1 8 1 1 6 1 6 1 1 6 6 1 1 1 6 1 6 1 6 6 1 1 1 1 8 1 1 1 6 1 6 4 1 6 1 1 1 1 1 6 1 6 4 1 1 4 1 1 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 8 1 1 1 8 1 8 6 1 8 1 1 1 1 1 8 1 8 8 1 1 6 1 H2604 D12 1 1 2 1 3 8 4 8 5 1 6 1 7 8 8 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 8 1 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 1 8 8 1 1 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 1 1 8 8 8 1 8 8 1 D19 1 1 6 6 1 1 6 6 6 1 1 8 8 D19 D22 D24 1 1 1 1 6 6 6 1 1 1 1 1 6 4 1 1 1 8 8 1 1 6 1 6 1 1 6 4 1 1 1 1 8 1 8 1 1 8 6 1 1 1 1 1 6 6 4 1 6 4 1 1 1 8 8 8 1 8 6 1 D22 D24 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 8 8 1 1 1 H2601 INNO-LiPA (HLA-B) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 D12 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 8 1 8 1 1 8 1 1 8 1 8 1 1 1 1 8 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 8 1 1 1 1 8 8 1 1 1 8 1 8 1 8 8 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 1 D19 1 1 6 1 1 1 6 1 1 6 1 6 1 6 1 1 6 1 1 4 1 6 1 1 1 1 6 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 4 6 1 1 1 1 6 4 1 1 1 6 1 6 1 6 6 6 1 6 1 1 8 8 1 1 1 1 D22 D24 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 8 1 8 1 1 8 1 1 8 1 8 1 1 1 1 8 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 6 8 1 1 1 1 8 6 1 1 1 8 1 8 1 8 8 8 1 8 1 1 8 8 1 1 1 1 H2602 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 D12 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 1 1 8 1 8 8 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 1 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 8 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1 D19 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6 6 1 1 4 1 6 4 1 1 4 1 1 6 1 1 1 6 1 1 6 1 1 1 6 6 6 1 1 1 1 6 1 1 6 1 6 4 1 1 1 1 6 1 1 6 4 4 1 6 1 6 6 1 1 1 1 2 D22 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 1 1 8 1 8 8 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 1 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 8 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1 D24 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 1 1 6 1 8 8 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 8 1 8 6 1 1 1 1 8 1 1 8 8 8 1 8 1 8 8 1 1 1 1 1 H2603 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 D12 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 8 1 8 1 8 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 8 8 1 8 1 8 8 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 D19 1 1 1 6 1 1 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 6 1 4 1 4 1 6 1 1 1 1 1 6 1 1 1 1 6 1 1 1 4 6 1 6 1 6 6 1 6 1 1 1 6 6 6 1 1 2 D22 D24 1 1 1 8 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 8 1 6 1 6 1 8 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 6 8 1 8 1 8 8 1 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 H2604 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 D12 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 1 1 8 8 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 8 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 8 1 1 1 8 1 1 1 8 1 8 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1 D19 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 1 1 6 4 1 1 6 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 6 6 1 1 1 6 6 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 6 4 1 1 1 6 1 1 1 6 1 6 1 6 1 1 8 1 1 1 8 2 D22 D24 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 1 1 8 8 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 8 8 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 6 1 1 1 8 1 1 1 8 1 8 1 8 1 1 8 1 1 1 8 1 INNO-LiPA (HLA-DRB1) : False positive H2601 D12 1 1 2 1 3 1 4 1 5 1 6 1 7 1 8 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 1 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 1 8 8 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 D19 1 1 1 1 1 1 1 4 1 2 1 1 6 6 6 1 1 1 1 1 6 8 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 D24 1 1 1 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 1 6 8 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 D12 1 1 2 1 3 1 4 1 5 1 6 1 7 1 8 1 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 1 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 D19 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 6 6 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 8 8 D24 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 8 8 H2602 H2603 D12 1 1 2 1 3 1 4 1 5 1 6 1 7 1 8 1 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 8 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 1 1 8 1 1 8 1 1 8 8 8 1 1 1 1 1 1 D19 1 1 1 1 1 1 1 1 6 2 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 1 2 8 2 1 6 2 1 6 8 6 1 1 1 1 1 1 D24 1 1 1 1 1 1 1 1 6 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 1 1 8 1 1 8 1 1 8 8 8 1 1 1 1 1 1 H2604 D12 1 1 2 1 3 1 4 1 5 1 6 1 7 8 8 1 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 8 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 8 8 1 1 8 1 8 1 D19 1 1 1 1 1 1 8 1 6 2 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 6 1 1 1 1 8 2 1 1 6 6 1 1 6 1 6 1 D24 1 1 1 1 1 1 8 1 6 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 1 8 1 1 1 8 8 1 1 8 1 8 1 結果 *日本人に多いアリルを優先するのであれば、どの施設も正解ですが、方法別では判定されたすべての アリルから選ぶのが原則ですので、正解とは言えない結果が多く見られました。昨年統一した、方法別の 結果報告の原則が徹底されていなかったようですので、今回は誤判定とはいたしません。 *26D19の施設はクラス1では弱いバンドが多く見られ、クラスⅡでは弱いfalse positiveが多く見られました。 発色ではなく増幅に問題があるかも知れません。 *C ローカスについては原則では多くが抗原型のambiguityとなるはずですので、本来は不正解となります。 *全体に、昨年お知らせした方法別判定の原則が守られておらず、日本人に多いアリルを優先して記載され たようです。