イルミナ次世代テクノロジーセミナー5 都市で開催

イルミナ次世代テクノロジーセミナー5 都市で開催！
■ お知らせ
「さらに進化する次世代シーケンサー：高性能化と汎用化の時代へ」
次回配信予定： 2010.06.30
急速にテクノロジーが進歩する次世代シーケンサー。スループットの向上だけではなく、使
GA関連論文
いやすさも自動化がさらに進み、高性能化と汎用化の時代へと突入いたしました。本セミ
検索しやすくなった英語版をお試
ナーでは、こうした次世代シーケンサーの最新情報と、実際にお使いの先生の招待講演を
し下さい
交えた内容となっています。
バックナンバー
まず前半は、どういった研究にどの機種が適しているのか、そしてサンプル調製から実際
のアプリケーション応用例をご説明しながら、現在のマイクロアレイ手法とあわせて次世代
お問い合わせフォーム
シーケンサーをどう使いこなすのかをご紹介いたします。mRNAだけでなく非コードRNAも
同時にシーケンスする新プロトコールも併せてご紹介。
後半はゲノム、エピゲノム、トランスクリプトームを代表する先生方に東京、京都、大阪会
場にてご発表いただきます。つくば、札幌会場ではデータ解析とアグリバイオ分野への応
用も含めてイルミナからご案内いたします。ぜひお聞き逃しなく！
■ 開催日程
つくば（7/6)、京都（7/8）、大阪（7/9）、東京（7/14）、札幌（7/16）
■ プログラム
13:30-14:00
すべての研究にシーケンサーのパワーを：イルミナ次世代シーケンサー機種のご紹介
14:00-15:00
次世代シーケンサーを使いこなすポイント
サンプル調製からゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム解析まで
15:20-16:10 招待講演
【東京会場】 「パーソナルゲノム時代の疾患研究」
東京大学医学部神経内科 辻省次先生
【京都会場】 「次世代エピゲノムツールで広がる発生分化および疾患のDNAメチル
化解析」
東京大学先端科学技術研究センター 永江玄太先生
【大阪会場】 「デジタルトランスクリプトーム解析による多面的な癌の標的探索」
東京大学先端科学技術研究センター 石川俊平先生
【つくば、札幌会場】 「次世代シーケンサーデータ解析とアグリバイオ分野への応用」
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イルミナ株式会社
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事前登録制、参加費無料
今月の論文ピックアップ：
一卵性双子ゲノム、自発性高血圧症ラット、RNA-Seqアセンブルツール
多発性硬化症の一卵性双子ゲノム解析
多発性硬化症の発症が不一致である一卵性双子のゲノム、エピゲノム、トランスクリプトー
ムをGenome Analzyerで解析。360 万SNP、あるいは 20 万indelではその差を見つけ
ることができず、またエピゲノム、トランスクリプトームでも発症の差を見つけることはできま
せんでしたが、一卵性双子の遺伝的背景をシーケンサーで解析した最初の論文です。
Genome, epigenome and RNA sequences of monozygotic twins
disconcordant for multiple sclerosis
自発性高血圧症ラットをシーケンス
SHR（自発性高血圧症ラット）を 10.7xでシーケンス。Brown Norwayと比べて 360 万
SNP、343Kのindelを発見。またcisのeQTLにマップされた遺伝子領域には非常にたくさ
んのSNP, indel, 欠失などがあることがわかりました。
The genome sequence of the spontaneously hypertensive rat: Analysis and
functional significance
Cufflinks: RNA-Seqによるトランスクリプトームアセンブルツール
オープンソースソフトウェアのCufflinksは既知の遺伝子アノテーション情報を必要としな
く、選択的転写やスプライスを説明するアルゴリズムです。マウス由来サンプルから 75bp
ペアエンドをシーケンスし、約 14000 の既知遺伝子と 3,724 の新たにアノテーションされ
た転写産物を検出。タイムコーススタディではTSSやスプライスアイソフォームで変化をみ
せた遺伝子も約 300 ありました。
Transcript assembly and quantification by RNA-Seq reveals unannotated
transcripts and isoform switching during cell differentiation
このニュースはイルミナ株式会社が毎月１回、月末に発行しています。
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