...

870 ul - RIKEN BRC DNA BANK

by user

on
Category: Documents
13

views

Report

Comments

Transcript

870 ul - RIKEN BRC DNA BANK
Genome Network PrdeCtFull― Length cDNA clone
RIKEN clone ID:IRAK168B02
VectOr:pBluescriptR
Accession
● Plasmid DNA puriflcation
中
→37°C
Date: lo ll iCI
Culture:LB(100 ug/ml Ampicillin)3 ml
Date: lC tl〔 I
PUttfication:QIAGEN Miniprep kit― dH20 100 ul
● Digestion by restriction enzyme/Concentrarion ca:ibration
Date i tC tttl
DNA concentration(0.D.): 261ら ヽ呼ら ng/ul
0、
Enzyme(Sac
Ⅱ+KpnI)
5 ul
0.5+0.5 ul
Buffer L
l ul
dH20
75 ul
丁otal
10 ul
Erectrophoresis: 1%agarose gel,l X TAE Buffer
H
Marker:2-Log DNA Ladder(NEB#N3200L)
kb
ヽ̀
エ
占
50-→
40
30-→
7B=
10-→
│←
K♭
∽
`
-1 2
05-→
← ス.9
(23
〈Expected digestlon pattern from BC067807.1〉
ぐθ
2曼 Qal?21o.122_Op.…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
…
● Attust plasmid DNA so:ution to 25 ng/ul
Date:/ク ///2
l
∼ preparation for shipping∼
Shipped i 25 ng/ul,40 ul
Final concentration:25 ng/ul
870 ul
千ら ng/ul)
DNA(■ 9し ヽ
10XTE
θSス
ノ
dH20
34ノ ダ ul
丁otal
/ク
ノ′j7
ul
ul
O/N
System:CEQ System
hdⅢ
―
―
―
‐
mm:獣 累[f・ 肥1了 出
│
――
―
―
―
―
―
―
―
―
―
-
1
―
Anaiyzed Data
Analyzed Data
Fri llノ 12′ 1015:55:09
Page:1
GNP
System:CEQ System
3::「 II「
:RAK168B02 Reverse2.B12 10111213X5
:RAK168B02 Reverse2.B12 10111213X5
11:話
ilI]
:nstrument:CEQ System(Ver・ 9.0.25)
Analyzed Data
TCTCAAT TO TTAO TO TCAAC TO TA ACCO ATOCAAO♀
ATC ACCCCACACTTATGTT TTCA TA TTACA TAC TTTTTOTTTAACA TTTTA TA AATTCCAAOCCT¬
1
│ III
II
II
│II
││ ││ ││ ,││││ │││││
││
││
││ ││ ││
I‖
│ │
│
│││││
│││││ │ ││
││
│ ││││ │
_J、
■
│
_卜
___ J‐
―
―一
L__
│
││
│
1_____L____1-―
―
●
C TTTTATAA TTOAAAATAAA AACTATA AGOAAAOTCAA AAAT0
I
│
││││
J
1
I
││
│ ││
│││
│││
│ ││
││
J____L____J__
1=_―
│
―
│
―・
│
___ __―
ハ
Fri ll′ 12ノ 1015:54:48
││
││
=J
││
――
│
十
一― 一
-1 ___J__
││
│
│
L
│`│
Page:1
BC067807 1 vs IRAK168B02 R●
: H/1″ t()lo9V つata
[ G口 NI]「 YX
Dat`ぅ
ヽ
′
erse2.l112
10111213X5
丁:tAK]68302 ・
「 7 Alデ
10111213X1 2010/11/12 16:08:54
BC06フ 8()7.l vs lRAK168B02 Rぃ vcrs02.212_]0111213X♭
oueγ y SOquenco
l
rile Nan10
: 2011)11 12
Seq、 lencc
3●
911eJly Seqller,ce
rilc Nant。
:
Sequorlce Narne
sequence size
1)`
i
Nan,●
lence si名 ●
りarg()t Seq■ ()`lCe
i]e Naに 、
o
〕C Nanie
: BC067807 1
「
S()qu●
: 2254
rile NamO
: IRAK168BO, T・ ,
ハ12
10111,13X5
: ]RAK168BO' Tフ .A12 1011]213X5
Na¬ ie
Seq、 lonce
Seq■ ()rlce SJ 2c
ぃeq
‐6
‐1
tlnit size to (IonlPa re
Pi cl( up l,OcJLl()n llo
Q:lery Ral、 りo:
, IRAК 1680C12 Revors()2 312 10111213X5 (coF・
`y Rar,9e:´
Rar19e: 198- -(1()1
Sbj ci:
6ゝ ,3
602 1Dp′ I卜「
T.Scorc: 2032′
1d()ntiし v: │,9' / 602 (99宅
st raI〕 d, 1'11」
011 e ry
SbJCt
90
Ouerv
61
cI、
,ery
Sbコ
Sbコ
TC.GCCCTTT」
CTACCCT(,(lA
││││││││││
く
)llery
:'01
t‐
ヽ
TTl
rTACCハ し
‐
‐ 2254
oPT.sco ro: 2286
)
ouery
1617
TAAG[「 TGTCC TCATA―
30jo「
l
TAAC,I「 ,IG(1(lC [F6ATA(lGl'A/ヽ
Cメ
「r c■ Gハ JIム TC(:C
、
CTTl'1l TAAA TT(:Tパ 「ICT CCATTTTAAl・
]`
61
A(CAlGTCT'' CATTTCAl(」 A GTCATACACC
CT(lAAATG(;C
CGAA`GT(16:r cCcccTcCTA
12[,
Ql」
III IIII III III III II II II IIII IIII
GC(:AAACC(り A CGハ ´(,(lTGG:J(ICGCC[GCTA
217
SbJ Ct
l'l
:
180
Querv
1845
GGAC(lC rccc (,CCGTCCヽ、
(1
2'7
SbJ Ct
240
Tl, CCTl'ATA(lTr ri「 TAtt FTT(〕 A
Query 1903 TcAGAAAll′ Jム AC[FC[「 TTG]黙 TGAi3Gげ ′ぜ TTTTGACIЦ `
││││││││││ ││││││││││ ││││││││││
IIIIIIIII I IIIIIII III I III IIIIII
GC(,ハ´Jヽ 1)CCA
CTCCccTCC(」 G(:ACGGrCcc cccGlCCnJ●
│││ ││││ │││
│││ │││ ││ ││
CTC(〕 G()TCCG
││ ││││ │ │││
ct
Ory
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
1786
A〔
,TA/・ Jご VPAC
CAT「 FCTACTA CA`ピ CArTAl・ ヂ
Tさヽ C′ ヽT「 CC(, 1螂 TTATC TTA― TTTl■
1111111111 1111111111 111 111111
181
Sb」
r′
CTTヽ AT CCTGハ A(:AAA
TATTCT'TATT ACム 」ヽ
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
l lllll llll ││││││││││ ││││││││││
ヽヽ
TT'A(lCF」 ヽ
Tl・ 〕 ATAAC()AAAC A(:ハ Jヽ T(:AGAT TA]T(〕 T rATl' ACハ ン
:│・ TAAT CCTGハ AGAAA
1〕
6()
TTGT01GTA「
TCCC TASA(],1∫ IGTl'
`r(■
:cTcTcTA ttAA(lGATCCC TACA(:パ TCl'T
rrcハ ′ば、
GA T― CG窓 〕TTr
llllllllll llllllllll l llllllll
TTTTTTATAA CA′
TTTTrl,rl i` Aへ
G膊 ヽTCAAA6A TCGGAハ
r,T,1'
(:r」
3,7
'・
(1
ヽA■・■ATC TTA.FTT「 FTA(1
Tハ ムCiヽ AT(3GG Tハ い」
1,CACIヽ プヽATAA ACTCTGハ
り rTttGAAAC T(1lGCヽふ(ソ ぶ
Ciヽ
`TAAitATAC IIIIIIIIII
CArTcTACTA IIIIIIIIII
CAl'CATTATT ││││││││││ │││ ││││││ ││││││││││
IIIIIIIIII
A[,Tメ
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
IIII IIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
AAハ GCACA.rT ACハ GTTTAじ ム
TGGCTCI:CTA AAA―
■
241
TIFI・ ア
GCCAty「
A,Vi`FLへ
GATT A(,AGTTTハ
CA TT3TGTGTAT
Sbョ
61 `GG:rACc(lcG TCCCAGGCAC
J963
T(じ ACAリ
lGTAl'T:PC.1(;CATirTApし
157
C′ ヽ
CA(lACI「
SbJ`:t
y、
1・
Ct
Qu● Iv
301
2023
VTハ Aハ AG
TI「
G TATGACGCAl'
Cijヽ llCCTTGC AATTl`
Al Aハ
││││││││││ ││││││││││ ││││││││││
ATTArAAAA(i CAA6`Crrc(】
ムン
、
1'1・
TTTTGA(ITTT' CCrTATAG7 r ]` Jl.「 A守・FTTCA
ハ AT`)│,7.Aノ ヽA(:A 小し
ヽ
A,(11・ プ
ヽ
TG「 Aバ IIATCIAAAム
IA`!か y、
A
││││││││││ ││││││││││ ││││││││││
A」
(lTTAAACFヽ
AAAAC,ATCT AAlAr(:A試
卜よ
CATAACICTC CCCTCATCCI TC(:ATCGCTT
ACAGTTCACA CTAACAATT(l ACA(ヽ rA]'ATT
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
157
3b功
361
42()
Ouery
2083
CCTCC′
GCT C(力 ヽCA(:T TTCrl l ACAA 7ビ TTA(:ACATC AAC(,TTl` Tけ、 ハGTTTC(,■・rT CT'cTATAACC
517
3bj cに
42J
CCTC(:ACArT l'I「 GTT TTGll.r T(:ATNrATTT んへTAAFじ ヽGA(l ACCTGTATAT CTTCCTCATT
TcAG CACA〕・「 GCF《 」 CTG八 1:GACCC ACCA(lCAC,AT
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
480
OuOry 2143 AT「 rTTTA■3T l'CCGT(,AATA TACCTG`rATC
577
3bJ Cに
3,8
I I III II III IIIII III I I I III IIIIII
r(,Arcc7 ■G(lAT(〕 SCT「
CAl'AAG ICT(]CC(〕 〔
:
ollerv 361 CCTCGAく
:AttT
IIIIIIIIII
458
ouerサ /
421
SbiCt
51 8
GCA「
Aく
TTCJA4ACAA TTTACACATC
IIIIIIIIII IIIIIIIIII
AA(1(り 11・ riヽ AA
AGTl"T(1(り 」
Prir cTc17ヽ friOし
[、
cc
llllllllll llllllllll llllllllll
::[CCC GAC(り TATT(lA(〕 A「 GTIビ
I IIIII IIII
GCATACTCCC
GACC.rA「 T(:A (:ATGTTICAC
CACAT'TCCAC CTCATCAG(C F(lCハ CCA(:AT
小ピ
ヽ 540
ITTCI卜kTG CATl・ΓGTCGT rAl・ rCATAA(, AA(]CACACCT ClAム AllTrAA TCA(:A「「1ワ ヽ
(」 ∈
57S
I I I I I I II I I
GGrrて 打AAT`:
O1lery 541 型■ ET(,C`rcA
3〔
SJDi ct
637
ouer.1
600
││││││││││ ││ │││││││
Cl・
TT'f`]:GGT rA-lCATAAG
AC,メ Vヽ 6CTCC
TTCFよGGA(,T
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
ハ語GCTCCTも ヽ ACハ′ヽ
ACCTCC rlど CA′ 、
GGiC`「
AT
11
601
SbJcL 697 Ar 698
││││││││││ │││││││ ││ ││││││││││
よ Tハ υ
ヽA
AAG(A(「 ACCT `ち lAハト
ACAC(11・
T(lACATlAAA
636
TATC r― AITT,ハ ユC CAGATCAC♪ Jゝ
599
││││││││││'│ ││││││││ ││││││ │ │
7ヽ
C,ヽ
ATTTAヽふ G (1た GATCCCC
¨ ,1・ rハ frc T′ 、
A
696
ct
481
V3ATЧ
`rT(,´ l■
TTGlЧ , TC APAIATTT
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
ACAGTrCACA C「 AACAATTC ACACrAT71T“
AATAAAA(,AC ACCT(3TATAI
TCGAバ A FGT
OuCry
2203
TTCATTTATG llC.「
3bit,●
541
,・ 1に ,rl,TTA[rc Tcrハ ュ:,■ IACA 「 (,GAA rATGl
I`
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
で
て
,TTCCTCATT
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
60
1781う
120
lε
`4
l l1 0 .
11)02
240
1962
300
2022
360
20:〕
2
420
2142
480
ACAA:「 TTATG AlllATC'` 1つ ム TCヽ ι
!TCAAT(lA
2202
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
、Tcム TC鍵 ヽ
TGA
ご
540
A(I:ビ 1,CCGT(:AATA TACCT(lTATC AC理 ヽ
ATTT]・ 1ツ ヽ
TTTttrG ATTATCrTハ
ぶふTTACA
1726
IIIIIIIIII IIIIII III IIIIIIIIII
A(1(,ATGT(〕「 T CATTTCAlGA C,TGATAC拓 ヽGG
Ouery
ATAAGCA烙,(: A(1ハ
lTAハハ
l'26
300
││ │││ ││││ │
Fiし
●uery
337
lハ ´」rCAAAハ A
rAA CItl・
│││││││ ││ │││││ ││││ ││││││││││
AGAACAAAG TAA]lG AAA距 ヽ ■TTTCCCFo3T T`[TTGG卜 AAC TClCCAAGλ A
ムGAAAG
CAt〕 ハ
口
le nt)
‐6
‐1
IIIIII I II I
GGACGC■ コヽ(11]
││││ ││││││
GAAT'rTAl G(:
J667
F21r・
60
II I I IIIII I
(lAATTT′ TTC(]
338
481
TCCGA`GGAC
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
III II II II I III III II I I
II IIIII II I
rCGGlGA(・ TG CCCACl'TGCC I「 C(,CA」 ヽGr(〕 G CCCCAGAt‐ C(l l_6CTC('T(り CT
'78
fbJct
CA(:(,(,C[「 (〕 1(1 1)に 'Tl,CC(1′ ヽ
(サ
│ ││ │││ ││││
SbJCし
OuOry
C(]CA(ナ
:Gl `lCGl」 ムCCGGG
rGACil(」 CCCACll'GGC CCCGAム 01,(〕 G CCCCAGA()C(` CGCTGCTCCT CCACGCA^`lT
Tcc(】 ′
24」
SbJct
CTCTCCGT(」 ()()AT(;tu C(:(,(A
││││││││││ ││││││││││
I II III IIII
218
Sbjcに
:
CTAC(lCTC(」 A CAGCCCn cTG (lC Tlll・
1 8J
ct
Ouery
:lC],CCCrcc cATCCCG(,Cli
TC(lCCCTTTT 、
III III IIII llllllllll llllllllll
12]
Ct
cuerY
3 / Pl tls
IIIIIIIIII IIIIIIIIII IIIIIIIIII
AGて ,GTCAA(:A GCC嘱 6CCGAム CCGTCCCCCC
lξ 8
sbjt,t
OL'T ScOro; 2358
)
A(lCGTCAA(]A CCCCGCCGハ′、CCCl'GGCG`iC CACAGA(〕
l
; 713
(:bJCt R● 119● : 1 - 3つ 2
592 bp′ INT_Sc()rel 144()′
:rdcntity: 58ら / 5ウ P (98名
sI■ and: Pユ 、
,s / MJ nus
0tl●
Dyぅ■メdFヽ
I BC06,807 1
: 2254
Ullit Size t● Conlpare
Jゃ 1,ocat'on No
Pi c'( ヽ
: 698
K168302 .r7.A12__]l1111213x520■
: l RIヽ ■ぐ168802 Roverse2 B12 10111213X5 t,eq
11て
Se qtter)ce size
To root SooЦ erlce
I lllヽ
Fm 2254
1111111111 1111111111 11
′
ヽ
ATT:,Cハハ小ハ AA′ ヽい
し
ヽヽAAAA AA 592
,コ ヽ
1・
AAア ヽrユ ニし
、
ぶュ′
TTCrヽ│し 、
換
16:08
Fly UP